基于DNA池重测序技术研究细毛羊LAMB1基因的SNPs分析-中国学术期刊网络出版总库

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基于DNA池重测序技术研究细毛羊LAMB1基因的SNPs分析

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【英文篇名】	SNPs Analysis of LAMB1 Gene in Fine-wool Sheep(Ovis aries) Based on the DNA Pools and Re-sequencing Technologies
【下载频次】	★★★★★
【作者】	赵冰茹; 黄锡霞; 田可川; 付雪峰; 徐新明; 何军敏; 吴伟伟;
【英文作者】	ZHAO Bing-Ru; HUANG Xi-Xia; TIAN Ke-Chuan; FU Xue-Feng; XU Xin-Ming; HE Jun-Min; WU Wei-Wei; College of Animal Science; Xinjiang Agricultural University; Xinjiang Academy of Animal Science;
【作者单位】	新疆农业大学动物科学学院; 新疆畜牧科学院;
【文献出处】	农业生物技术学报 , Journal of Agricultural Biotechnology, 编辑部邮箱 2016年 12期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	DNA池重测序; 层粘连蛋白β1基因(LAMB1); 细毛羊; 遗传效应; 关联分析;
【英文关键词】	DNA pool and re-sequencing; Laminin-beta-1(LAMB1) gene; Fine-wool sheep; Genetic effects; Correlation analysis;
【摘要】	层粘连蛋白β1(laminin-beta-1,LAMB1)作为层粘连蛋白家族成员之一,在生物过程中发挥极为重要的作用。为了分析细毛羊(Ovis aries)毛性状相关候选基因LAMB1的遗传效应,本研究通过DNA池重测序技术筛选了LAMB1基因外显子区的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),对其使用聚合酶链反应-单链构象多态性(single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products,PCR-SSCP)技术分型,在此基础上,利用SAS 8.1的GLM程序分析其对新疆巩乃斯种羊场418只细毛羊毛性状的遗传效应,利用Haplo View 4.2软件进行连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析。结果显示,该细毛羊群体遗传变异处于中等水平,LAMB1的5个SNPs发生错义突变。SNP2中AA和GA基因型个体鉴定时体重、剪毛后体重极显著高于GG基因型个体(P<0.01);SNP4中CC、TT和TC基因型个体间的自然长度差...
【英文摘要】	Laminin-beta-1(LAMB1) gene is the member of the laminin family, and plays an important role in biological processes. To analyze the genetic effects associated with the wool traits of candidate genes LAMB1,based on DNA pools with the re- sequencing technology to screened 5 single nucleotide polymorphisms(SNPs) data of LAMB1 gene exon regions, combining with single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products(PCR- SSCP) technology to type the genotype, the genetic effects of...
【基金】	国家自然科学基金(No.31360543和No.31460593); 国家毛绒羊产业技术体系子课题(No.CARS-40); 新疆农业大学产学研联合培养研究生示范基地项目(No.xjaucxy-yjs-20152012)
【更新日期】	2016-12-01
【分类号】	S826
【正文快照】	随着分子生物技术的发展,细毛羊(Ovis aries)育种过程中分子标记技术逐渐发挥重要作用,从分子水平研究候选基因与细毛羊经济性状之间的关联性,筛查出具有优良基因的种羊,可以提高选择效率与准确性,对细毛羊育种和生产具有重要意义。层粘连蛋白β1基因(laminin-beta-1,LAMB1)是?

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