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【英文篇名】 |
Analysis of Bacterial Community Structure in Vineyard Soil by RT-PCR and High Throughput Sequencing |
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【下载频次】 |
★★★★★ |
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【作者】 |
王晓雯;
洪振瀚;
刘安瑞;
罗立新; |
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【英文作者】 |
WANG Xiaowen;
HONG Zhenhan;
LIU Anrui;
LUO Lixin;
School of Biosciences and Bioengineering;
South China University of Technology; |
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【作者单位】 |
华南理工大学生物科学与工程学院; |
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【文献出处】 |
酿酒科技
, Liquor-Making Science & Technology, 编辑部邮箱
2016年 11期
期刊荣誉：ASPT来源刊 中国期刊方阵 CJFD收录刊 |
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【中文关键词】 |
葡萄园土壤;
根际土壤;
细菌多样性;
高通量测序;
荧光定量PCR; |
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【英文关键词】 |
vineyard soil;
rhizosphere soil;
bacterial diversity;
high throughput sequencing;
quantitative PCR(Q-PCR); |
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【摘要】 |
土壤细菌在葡萄园生态系统中起着重要作用,具有十分重要的生态功能。以贵州镇远葡萄园基地根际、非根际土壤为研究对象,在对土壤的基本理化指标及酶活检测的基础上,采用荧光定量PCR(Q-PCR)和Illumina Miseq高通量测序技术对葡萄园根际和非根际土壤的细菌菌群结构进行分析。结果表明,葡萄园根际土壤细菌16S r RNA基因的拷贝数在1.38×108~1.17×109copies/g之间,高于非根际土壤。Illumina Miseq高通量测序显示,葡萄园根际土壤细菌呈多样性分布且优势菌群突出,主要涵盖了变形菌门(Protecbacteria),放线菌门(Actinbacteria),酸杆菌门(Acidobacteri),厚壁菌门(Firmicute),绿弯菌门(Chloroflexi),蓝藻门(Cyanobacteria),泉古菌门(Crenarchoeo),拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadete),硝化螺旋菌门(Nitrospirae)。其中变形菌门和放线菌门为优势菌群,两者相对丰度之和占到了53.33%~67.28%。葡萄园根际土壤的主要优势细菌属包括乳球菌属... |
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【英文摘要】 |
Soil bacteria have important ecological functions and play a very important role in vineyard ecological system. In this study, we performed quantitative PCR(Q-PCR) and Illumina Miseq high-throughput sequencing to compare the basic physiochemical parameters, enzymatic activities and bacterial groups between the rhizosphere and non-rhizosphere soil from a vineyard from Zhenyuan, Guizhou. Q-PCR results indicated that, the bacterial 16 S r RNA gene copy numbers in the rhizosphere soils ranged from 1.38×108to 1.... |
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【基金】 |
华南理工大学“学生研究计划”(SRP)项目(105612015S533) |
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【更新日期】 |
2016-12-13 |
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【分类号】 |
S154.3;S663.1 |
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【正文快照】 |
土壤根际是一个特殊的生态系统,它与周围非根际土壤在化学、生物学等特性上具有显著差异[1]。它易受植物根系的影响,是有益微生物及有害微生物与宿主植物发生复杂相互作用的一个微小区域,蕴含着丰富的微生物资源[2]。其中,细菌是根际土壤中数量最丰富、种类较多的微生物类群,广 |
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