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两种不同生境植物棉花与雪莲CDPK1基因的克隆及生物信息学分析  
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【英文篇名】 Cloning and bioinformatics analysis of CDPK1 gene in Gossypium hirsutum and Sasussured involucrata from two different habitats
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【作者】 田晓涵; 刘玉玲; 李永梅; 李锦; 庞学兵; 祝建波; 朱新霞;
【英文作者】 TIAN Xiao-han; LIU Yu-ling; LI Yong-mei; LI Jin; PANG Xue-bing; ZHU Jian-bo; ZHU Xin-xia; College of Life Science; Shihezi University;
【作者单位】 石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室;
【文献出处】 江苏农业学报 , Jiangsu Journal of Agricultural Sciences, 编辑部邮箱 2016年 05期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 钙依赖性蛋白激酶(CDPK); 生物信息学; 序列分析; 结构预测;
【英文关键词】 calcium-dependent protein kinase(CDPK); bioinformatics; sequence analysis; structure prediction;
【摘要】 为了研究两种不同生境植物钙依赖性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差异,分别从冷敏感作物陆地棉和高耐寒植物天山雪莲中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通过生物信息学分析发现,GhCDPK1和SikCDPK1的开放阅读框长度分别为1 764 bp和1 716 bp,各编码587和571个氨基酸。蛋白质表现为弱酸性,且不稳定,亲水;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功;无跨膜结构域和信号肽,有多个磷酸化位点,但数量存在差异;均具有典型的CDPK保守结构域。GhCDPK1和SikCDPK1氨基酸序列同源性为79.9%,二者明显的区别在于GhCDPK1含有4个EF-hand基序,但SikCDPK1只存在2个EF-hand基序。进化分析结果表明,GhCDPK1与可可CDPK1亲缘关系最近,SikCDPK1与菊花CDPK2亲缘关系最近。
【英文摘要】 To study the functional differences of calcium-dependent protein kinase gene 1( CDPK1) in different habitats,2 calcium-dependent protein kinase genes GhC DPK1 and SikC DPK1 were obtained from coldness-sensitive crop Gossypium hirsutum and hardy plant Sasussured involucrata Kar. et Kir,respectively. GhCDPK1 gene contains a 1 764-bp open reading frame encoding 587 amino acids,and SikC DPK1 contains a 1 716-bp open reading frame encoding 571 amino acids. The corresponding proteins are unstable,hydrophilic and ...
【基金】 新疆生产建设兵团项目(2014CC005); 国家自然科学基金项目(31360053); 石河子大学育种专项(gxjs2014-yz04)
【更新日期】 2016-11-28
【分类号】 Q943.2
【正文快照】 极端温度、干旱和土地盐渍化等逆境严重影响学院棉花研究所提供,天山雪莲(Sasussured involu-农作物的生长、发育和产量。研究作物抗性分子机crata Kar.et Kir)无菌苗由石河子大学农业生物技理,提高作物对逆境的适应性是提高农作物产量与术重点实验室保存。品质的基础。外界刺?

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