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火炬松生长和松脂性状相关候选基因的单核苷酸多样性分析  
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【英文篇名】 Analysis of single nucleotide polymorphisms within candidate genes involved in growth and resin biosynthesis of loblolly pine
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【作者】 杨会肖; 刘天颐; 徐斌; 刘纯鑫; 王金榜; 黄少伟;
【英文作者】 YANG Huixiao; LIU Tianyi; XU Bin; LIU Chunxin; WANG Jinbang; HUANG Shaowei; Guangdong Academy of Forestry; Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm; College of Forestry and Landscape Architecture; South China Agricultural University; Yingde Institute of Forestry;
【作者单位】 广东省林业科学研究院; 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/华南农业大学林学与风景园林学院; 英德市林业科学研究所;
【文献出处】 华南农业大学学报 , Journal of South China Agricultural University, 编辑部邮箱 2016年 01期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 火炬松; 候选基因; 单核苷酸多态性; 连锁不平衡;
【英文关键词】 loblolly pine; candidate gene; single nucleotide polymorphism(SNP); linkage disequilibrium(LD);
【摘要】 【目的】对火炬松Pinus taeda生长和松脂产量相关功能基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行筛选与分析,为分子标记辅助育种提供技术基础。【方法】利用生物信息学对火炬松c DNA文库进行整理、比对、剪接、注释,挑选出与生长素、赤霉素、细胞分裂素及蒎烯合成相关的非重复序列基因(Unigene)作为候选基因片段,利用MEGA5.0和Dna SP4.0软件对火炬松36个单株的8个候选基因片段进行序列比对和分析。【结果】所测序列总长为5 177 bp,检测到184个SNP位点,平均36.9 bp的基因序列中出现1个SNP位点,其中123个为非同义突变、61个为同义突变SNP位点。核苷酸多态性πa和θw分别为0.020和0.016。对8个候选基因片段内SNP位点进行的连锁不平衡分析显示,随着核苷酸序列长度的延伸,SNP位点的连锁不平衡在基因内部迅速衰退(R2≤0.2)。【结论】在火炬松中,基于候选基因内SNP位点间的连锁不平衡作图是可行的。
【英文摘要】 【Objective 】 Single nucleotide polymorphisms( SNPs) within candidate genes involved in growth and resin biosynthesis of loblolly pine,Pinus taeda,were screened and analyzed,preparing technical basis for later marker-assisted breeding.【Method】The candidate unigenes related to auxin,gibberellins,cytokinins or pinene synthesis were selected from loblolly pine c DNA library using bioinformatics.The sequences of eight candidate genes from 36 loblolly pine individuals were aligned and compared using MEGA5. 0 and ...
【基金】 广东省林业科技创新专项资金(2011KJCX013-02); “十二五”农村领域国家科技计划专题(2012BAD01B0203); 联合国发展计划署援建的火炬松改良种子园项目(CPR/91/153;1992-1996)
【更新日期】 2016-02-02
【分类号】 S718.4
【正文快照】 优先出版网址:http://www.cnki.net/kcms/detail/44.1110.s.20151207.1133.028.html林木的重要性状大多属于数量性状,由许多基因和环境共同作用来调控其生长与发育。传统的数量遗传学不能检测控制数量性状的基因的数量、基因在染色体上的位置、每个位点的贡献大小以及基因间的?

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