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水稻线粒体特异序列在细胞质多态性鉴定中的应用  
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【英文篇名】 Application of Rice Mitochondrial Specific Sequence in the Polymorphisms Identification of Rice Cytoplasm
【下载频次】 ★★★
【作者】 谢红卫; 钱明娟; 潘境涛; 袁林峰; 蔡怡聪; 毛凌华; 李永辉; 曹志斌; 聂元元; 颜龙安; 蔡耀辉;
【英文作者】 Xie Hongwei; Qian Mingjuan; Pan Jingtao; Yuan Linfeng; Cai Yicong; Mao Linghua; Li Yonghui; Cao Zhibin; Nie Yuanyuan; Yan Longan; Cai Yaohui; Jiangxi Super-rice Research and Development Center/National Engineering Laboratory of Rice(Nanchang); Nanchang University; China National Rice Research Institute;
【作者单位】 江西省超级水稻研究发展中心/水稻国家工程实验室(南昌); 南昌大学; 中国水稻研究所;
【文献出处】 基因组学与应用生物学 , Genomics and Applied Biology, 编辑部邮箱 2016年 10期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 线粒体特异序列; 细胞质; 分子标记; 水稻;
【英文关键词】 Mitochondrial specific sequence; Cytoplasm; Molecular markers; Rice;
【摘要】 为了开发一套用于水稻细胞质多态性鉴定的分子标记,本研究通过对已测序的4个水稻线粒体基因组CW-CMS、LD-CMS、Nipponbare和9311线粒体基因组进行比较分析,获得55个大于100 bp的线粒体特异序列,并开发出一套水稻线粒体特异序列分子标记。该套分子标记稳定可靠,在对随机选择的23个水稻品种的线粒体组型鉴定中,共有24个线粒体特异标记扩增出多态性,使用UPGMA法聚类分析,在相似系数为0.46,可以将23水稻品种分为2大类群,其中第一大群可分为两个小类群,类群Ⅰ为粳稻聚类群,该类群大部分为粳稻品种,同时也有2个籼稻品种,推测这两个品种细胞质来源于粳稻;类群Ⅱ包含两个籼稻品种,与粳稻的细胞质亲缘关系较近;而第二大聚类群全部为籼稻品种,大部分品种间多态性丰富。因此,该套水稻线粒体特异序列标记可用于水稻细胞质多态性鉴定分析,同时该类型分子标记的开发对于其他物种的细胞质多态性鉴定具有指导意义。
【英文摘要】 In order to develop a set of molecular markers for the identification of cytoplasmic polymorphism,four sequenced mitochondrial genomes of rice CW-CMS,LD-CMS,Nipponbare and 9311 were compared,55 specific sequence above 100 bp were detected,which were translated into a set of rice mitochondrial specific markers.The markers were stable and reliable,23 rice varieties randomly selected were PCR amplification analyzed,24 markers showed polymorphism,based on which,the rice varieties could be divided into two categ...
【基金】 国家自然科学基金(31360332); 江西省科技计划重大项目(20143ACF60008); 江西省科技支撑计划(20123BBF60187); 江西现代农业科研协同创新专项(JXXTCX2015006-002); 江西省农业科学院博士启动基金项目(20141CBS001)共同资助
【更新日期】 2016-12-02
【分类号】 S511
【正文快照】 Application of Rice Mitochondrial Specific Sequence in the PolymorphismsIdentification of Rice CytoplasmXie Hongwei1Qian Mingjuan1Pan Jingtao2Yuan Linfeng1Cai Yicong3Mao Linghua1Li Yonghui1Cao Zhibin1Nie Yuanyuan1Yan Longan1*Cai Yaohui1*1 Jiangxi Super-ri

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