液相色谱-串联质谱法分析大鼠血液中基因组DNA羟甲基化水平-中国学术期刊网络出版总库

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液相色谱-串联质谱法分析大鼠血液中基因组DNA羟甲基化水平

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【英文篇名】	Analysis of Global DNA Hydroxymethylation in Rats' Blood by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry
【下载频次】	★★★★★
【作者】	陈光照; 杨柳青; 文娟; 葛苗苗; 张立坚; 蔡春;
【英文作者】	CHEN Guang-zhao; YANG Liu-qing; WEN Juan; GE Miao-miao; ZHANG Li-jian; CAI Chun; Analysis Center of Guangdong Medical College; West China School of Pharmacy; Sichuan University;
【作者单位】	广东医学院分析中心; 四川大学华西药学院;
【文献出处】	质谱学报 , Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 编辑部邮箱 2015年 03期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	5-羟甲基胞嘧啶(5hm C); 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS); DNA羟甲基化; 血液; 大鼠;
【英文关键词】	5-hydroxymethylcytosing(5hm C); liquid chromatography-tandem mass spectrometry(LC-MS / MS); DNA hydroxymethylation; blood; rat;
【摘要】	5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)生成的,对哺乳动物的基因转录和表达发挥着重要的调控作用。本研究建立了血液样品中5hm C的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)测定方法,采用试剂盒法提取血液基因组DNA,在甲酸环境下加热裂解,采用HILIC色谱柱分离,电喷雾电离和多反应监测模式定量。结果表明:5hm C在0.1~50μg/L范围内线性关系良好,相关系数为0.999 4;高、中、低3个加标水平的平均回收率为95.87%,日内和日间的相对标准偏差分别为3.42%和4.12%;5hm C的检出限(LOD,S/N=3)为0.050μg/L,定量限(LOQ,S/N=10)为0.100μg/L。该方法准确、快速、稳定、灵敏,可用于血液样品全基因组中5-羟甲基胞嘧啶的检测分析。
【英文摘要】	5-Hydroxymethylcytosine(5hm C),which was formed from the enzymatic oxidation of 5-methylcytosine(5m C) by TET proteins family,played an important role in gene transcription and expression regulation as a new epigenetic modified in mammal animal. A method for global DNA hydroxymethylation in blood sample of rats using hydrophilic interaction liquid chromatography-tandem mass spectrometry( LC-MS / MS) was developed. Genomic DNA from blood samples was extracted by genomic DNA isolation kit,and then was hydroly...
【基金】	国家自然科学基金(21375029); 广东省学科建设基金(2013CXZDA018)资助
【更新日期】	2015-06-03
【分类号】	O657.63;R927.2
【正文快照】	DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)介导下,以S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl-L-methionine,SAM)为甲基供体,将1个甲基共价结合到胞嘧啶环(Cyt)第5位碳原子上,成为5-甲基胞嘧啶(5m C),5m C在TET(ten-eleven translocation)蛋白加双氧酶家族催化氧化下生成5-

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