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ACLSV山东苹果分离物基因重组及CP序列多样性分析  
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【英文篇名】 Analysis of Genome Recombination and CP Sequence Diversity of ACLSV Apple Isolate from Shandong
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【作者】 李科; 时洪伟; 荆陈沉; 孙现超; 周常勇; 青玲;
【英文作者】 LI Ke; SHI Hong-wei; JING Chen-chen; SUN Xian-chao; ZHOU Chang-yong; QING Ling; College of Plant Protection; Southwest University/Chongqing Key Laboratory of Plant Disease Biology; Citrus Research Institute; Chinese Academy of Agricultural Sciences;
【作者单位】 西南大学植物保护学院/植物病害生物学重庆市高校级重点实验室; 中国农业科学院柑桔研究所;
【文献出处】 中国农业科学 , Scientia Agricultura Sinica, 编辑部邮箱 2015年 14期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 苹果褪绿叶斑病毒; 基因组; 外壳蛋白; 多样性; 重组分析;
【英文关键词】 Apple chlorotic leaf spot virus(ACLSV); genome; coat protein; diversity; recombination analysis;
【摘要】 【目的】明确苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)山东苹果分离物全基因组的分子特征、潜在重组事件及CP基因的多样性。【方法】采用RT-PCR分段扩增、克隆、拼接获得ACLSV全基因组序列,对其进行分子特征描述,并与已报道的16条全长基因组或近全长基因组序列进行比较和系统发育分析,同时扩增其CP进行多样性分析。【结果】扩增得到ACLSV山东苹果分离物QD-13全基因组序列(Gen Bank登录号KJ522693),QD-13全长7 557 nt,包含3个ORF。构建进化树分析表明,QD-13与日本苹果分离物B6聚为一簇,二者相似性最高,为85.9%。17条ACLSV分离物基因组分段比较表明,5′端和3′端差异较大;ORF3保守性相对较高,除分离物Ta Tao 5和MS外,其推导的氨基酸序列相似性均在91.2%以上。ORF1编码区527—665 aa区域保守性差,所比较的17条序列在该区域的相似性为15.4%—59.7%。基因组重组分析以P≤0.05为标准,3种以上算法同时检测到则为有意义重组事件,结果显示,QD-13存在3个重组事件,它们分别发生在6 50...
【英文摘要】 【Objective】The objective of this study is to determine the molecular characterization and potential recombination events of genome of Apple chlorotic leaf spot virus(ACLSV) isolated from apple in Shandong Province, and diversity of CP gene of these ACLSV isolates.【Method】The whole genome sequence of ACLSV was obtained by RT-PCR through segment amplification, cloning and gene splicing. The molecular characterization and phylogeny of whole genome of ACLSV were then described and analyzed by comparison with re...
【基金】 国家公益性行业(农业)科研专项(201203076-04)
【更新日期】 2015-07-31
【分类号】 S436.611
【正文快照】 0引言【研究意义】苹果褪绿叶斑病毒(Apple chloroticleaf spot virus,ACLSV)为纤毛病毒属(Trichovirus)的代表成员[1],是危害苹果和梨的主要病毒病原之一,在中国各苹果产区广泛分布[2]。ACLSV为潜隐病毒,往往在寄主植物上不表现明显的症状,常与苹果茎沟病毒(Apple stem groovi

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