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基于全基因组的微生物亲缘关系与分类系统研究工具——CVTree  
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【英文篇名】 Research Tool for the Genetic Relationship and Classification System Based on the Whole Genome CVTree3
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【作者】 左光宏; 郝柏林;
【英文作者】 Zuo Guanghong; Hao Bailin; Fudan University Department of Physics and Theory of Life Sciences;
【作者单位】 复旦大学物理系和理论生命科学研究中心;
【文献出处】 生物技术通报 , Biotechnology Bulletin, 编辑部邮箱 2015年 11期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 CVTree; 原核生物; 全基因组; 亲缘关系树; 分类系统;
【英文关键词】 CVTree; prokaryotic genome; phylogenetic tree; classification system;
【摘要】 组分矢量构树(CVTree)方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据的海量增加;它自动对比物种亲缘关系与分类系统,并在网页上以交互作用形式显示,从而使研究更加直观。使用CVTree3网络服务器,用户可以快速的对未知的全基因组序列进行亲缘关系分析,并对其分类地位进行初步鉴定。由于合理利用全基因组信息,CVTree方法能对种以下的亲缘关系与分类具有高分辨力。随着CVTree方法的深入与完善,希望其能成为阐明原核生物亲缘关系与分类系统的定义性的工具。
【英文摘要】 Component vector of Broussonetia papyrifera(cvtree)method is based on whole genome, without sequence alignment and phylogenetic relationships among species research methods. CVTree3 is our latest development of the CVTree network server. It is based on the core program of parallel, in order to adapt to the current increase in the amount of genomic data, it is automatically compared with the species phylogenetic relationship and classification system, and on the web page to interact with the form of display,...
【基金】 国家重点基础研究“973”计划(2007CB814800,2013CB834100)
【更新日期】 2015-12-21
【分类号】 Q939
【正文快照】 分类是人类认识自然、探索事物本质及其规律的基本出发点之一。对生命形式最早的分类系统能上朔到古希腊哲学家亚里士多德(Aristotle)。对于物种间亲缘关系与分类系统的研究,不仅加深人们对于自然界的认识,还能为一些与人类生命健康有关的应用科学,如医学微生物学与环境元基因?

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