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亚洲棉全基因组中NAC类转录因子基因的鉴定与分析  
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【英文篇名】 Genome-Wide Identification and Analysis of NAC Transcription Factor Gene Family in Gossypium arboretum L.
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【作者】 赵灿; 刘任重; 柳展基; 李菲; 王立国; 马骏骏; 朱新霞;
【英文作者】 ZHAO Can; LIU Renzhong; LIU Zhanji; LI Fei; WANG Liguo; MA Junjun; ZHU Xinxia; Key Laboratory of Agrobiotechnology; College of Life Sciences; Shihezi University; Shandong Cotton Research Center;
【作者单位】 石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室; 山东棉花研究中心;
【文献出处】 石河子大学学报(自然科学版) , Journal of Shihezi University(Natural Science), 编辑部邮箱 2015年 04期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 NAC转录因子; 棉花; 亚洲棉; 生物信息学;
【英文关键词】 NAC transcription factor; cotton; Gossypium arboretum L; bioinformatics;
【摘要】 为了开发棉花NAC基因资源,本文利用生物信息学方法在亚洲棉基因组中预测了138个NAC基因,根据其在染色体上的位置关系命名为Ga NAC001-Ga NAC138,所有Ga NAC基因分布于亚洲棉13条染色体上。根据Ga NAC蛋白的序列相似性及系统进化分析,将亚洲棉Ga NAC蛋白分为11个亚家族,每个亚家族的Ga NAC蛋白数目为4-25个。基因结构分析发现,大部分(63.7%)Ga NAC基因含有2个内含子。比较亚洲棉与陆地棉、雷蒙德氏棉NAC蛋白的同源性,发现亚洲棉与雷蒙德氏棉NAC蛋白的匹配程度高于陆地棉,平均序列一致性分别为93.9%和81.2%,一些NAC基因(58/138)在棉属的进化过程中高度保守,一些(37/138)则变异程度较大,可能是生物体为了适应环境的变化产生了新的功能。本研究结果为亚洲棉及陆地棉NAC转录因子基因的后续深入研究提供了重要参考。
【英文摘要】 In order to develop the cotton NAC gene resource,in this study,138 NAC transcription factor family genes were identified from Gossypium arboretum L. by bioinformatics method,which were named as Ga NAC001-Ga NAC138 based on their chromosomal locations,respctively.According to the similarity of the amino acid sequences and the phylogenetic tree analysis,all the Ga NAC genes were clustered into 11 distinct subfamilies.Genes structure analysis indicated that most of Ga NAC(62.4%)genes contained two introns.Homo...
【基金】 国家棉花产业技术体系(CARS-18-10); 山东省农业生物资源创新利用研究项目; 新疆生产建设兵团“新疆特色植物基因资源研究与利用创新团队”项目(2014CC005); 石河子大学育种专项(GXJS2014-YZ04)
【更新日期】 2015-10-27
【分类号】 S562
【正文快照】 NAC转录因子是广泛存在于植物中的一类转录因子。1996年Souer等[1]在矮牵牛(Pharbifis nil L.)中克隆了第一个NAC转录因子基因NAM(no apicalmeristem),其nam突变株不能形成顶端分生组织,大部分突变体在幼苗期便死亡,少数存活突变体的花器官发育异常。1997年Aida等[2]首先报道了

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