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【英文篇名】 |
Hox Genes and Their Expression Pattern in Early Development of Litopenaeus vannamei |
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【下载频次】 |
★★★★★ |
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【作者】 |
孙晓晴;
隗健凯;
袁剑波;
张晓军;
李富花;
相建海; |
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【英文作者】 |
SUN Xiao-Qing;
WEI Jian-Kai;
YUAN Jian-Bo;
ZHANG Xiao-Jun;
LI Fu-Hua;
XIANG Jian-Hai;
The Key Laboratory of Experimental Marine Biology;
Institute of Oceanology;
Chinese Academy of Sciences;
University of Chinese Academy of Sciences; |
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【作者单位】 |
中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室;
中国科学院大学; |
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【文献出处】 |
中国海洋大学学报(自然科学版)
, Periodical of Ocean University of China, 编辑部邮箱
2015年 08期
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊 |
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【中文关键词】 |
Hox基因;
凡纳滨对虾;
甲壳动物;
早期发育;
表达模式; |
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【英文关键词】 |
Hoxgene;
Litopenaeus vannamei;
crustacean;
early development;
expression pattern; |
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【摘要】 |
Hox基因是决定动物形态多样性的关键基因,同一类型Hox基因的同源异型结构域(Homeodomain)序列及其功能在进化上高度保守。甲壳动物是仅次于昆虫的第二大类节肢动物,但有关其Hox基因研究在深度和广度上都远远不如昆虫。本研究首先通过RNA-Seq测序技术和生物信息学方法分析发现在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)中存在13种Hox基因,分别为Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、Lvantp、Lvubx、LvabdA、LvabdB、Lvmsx、Lvmnx和Lvdll;然后根据RNA-Seq数据,克隆获得了这13条基因的开放阅读框(ORF)的cDNA序列,并对其序列结构、早期发育表达模式及同源关系进行了初步分析。序列分析显示这些Hox基因的结构非常保守,同源比对显示同一类型的Hox基因的氨基酸序列在不同物种之间具有较高的保守性;表达模式分析结果发现,不同Hox基因在早期发育过程中的表达模式不同,从囊胚期开始,按时序表达的先后顺序基本为Lvmsx、Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、Lvmnx、Lvdll、Lvantp... |
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【英文摘要】 |
Hox genes involve in early embryonic development of animals and regulate the formation of body segments,tissues and organs.They have been widely studied to explain the morphological development and evolution in insects,especially in Drosophila,but rarely in crustaceans,which is the second largest group of arthropods.In this study,by RNA-seq sequencing and bioinformatics analysis,we found 13 Hoxgenes in Pacific white shrimp(Litopenaeus vannamei):Lvlab,lvpb,lvhox3,lvdfd,lvscr,lvftz,lvmsx,lvdll,lvmnx,lvantp,lv... |
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【基金】 |
国家高技术研究发展计划项目(2012AA092205;2012AA10A404);
国家自然科学基金项目(31172396;31272683)资助 |
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【更新日期】 |
2015-08-27 |
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【分类号】 |
S917.4 |
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【正文快照】 |
Hox基因是后生动物中普遍存在的一类含有同源框(Homeobox)的基因,它们都具有一段约180bp的可转录出约60个氨基酸的同源异型结构域(Home-odomain)保守蛋白的序列。这类基因在基因组上成簇存在,同一类型Hox基因在进化上高度保守。Hox基因调控生物体轴形成,参与动物早期胚胎发育,? |
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