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生物事件触发词识别方法研究

Research on Tagging Biomedical Event Trigger

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【作者】 魏小梅黄钰陈波姬东鸿

【Author】 WEI Xiao-mei;HUANG Yu;CHEN Bo;JI Dong-hong;College of Computer,Wuhan University;College of Informatics,Huazhong Agricultural University;

【机构】 武汉大学计算机学院华中农业大学信息学院

【摘要】 从生物文献中抽取生物事件对于生物领域的知识挖掘起着重要的作用,而事件触发词的识别是生物事件抽取的一个关键步骤。系统分别采用词汇及其上下文特征、短语标记特征、词聚类特征以及统计的词典特征构造不同的基于词级的CRF模型,用于生物事件触发词的标记。然后针对不同的触发词类型选择对应最优的标记模型,构造了一个混合CRF模型。在BioNLP 2009ST语料库上进行了实验评估,结果表明提出的方法取得了很好的性能,为生物事件的抽取建立了良好的基础。

【Abstract】 Event extraction from biomedical literature plays an important role in the knowledge mining in biomedical domain.The trigger identification is the key step in biomedical event extraction.We used rich features including lemma,context,phrase label,word cluster and learned trigger dictionary to build several kinds of CRF models.Then we chose the best model for each type of triggers to combine a hybrid model.The evaluation on the BioNLP 2009 ST data set shows that our approach achieves good performance,which lays foundation for biomedical event extraction.

【关键词】 生物事件触发词CRF模型Brown Cluster特征
【Key words】 Biomedical eventTriggerCRF modelBrown ClusterFeature
【基金】 国家自然科学基金(61202304,61173095,61202193);国家哲学社会科学重大计划招标项目(11&ZD189)资助
  • 【文献出处】 计算机科学 ,Computer Science , 编辑部邮箱 ,2015年10期
  • 【分类号】TP391.1
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】137
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