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差异基因表达谱分析颈动脉不稳定斑块相关基因及可能的信号通路  
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【英文篇名】 Differential gene expression profiling for identification of potential pathogenic genes and pathways in carotid unstable plaques
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【作者】 奈文青; 刘灏; 王媛媛; 单兰兰; 傅友; 吴洪渊; 丁燕; 陈顺枝; 刘正军; 陈婕; 戴萌;
【英文作者】 NAI Wenqing; LIU Hao; WANG Yuanyuan; SHAN Lanlan; FU You; WU Hongyuan; DING Yan; CHEN Shunzhi; LIU Zhengjun; CHEN Jie; DAI Meng; Department of Health Management; Nanfang Hospital of Southern Medical University; Department of Vascular Surgery; Huarui Hospital of Southern Medical University; Department of Ultrasound; Gui Zhou hospital of Shunde District;
【作者单位】 南方医科大学南方医院健康管理科; 南方医科大学南方医院血管外科; 南方医科大学华瑞医院健康管理科; 佛山市顺德区桂洲医院超声科;
【文献出处】 南方医科大学学报 , Journal of Southern Medical University, 编辑部邮箱 2015年 05期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 不稳定斑块; 动脉粥样硬化; 表达谱; 差异表达基因; 生物信息学;
【英文关键词】 unstable plaque; atherosclerosis; expression profile; differential expressed genes; bioinformatics;
【摘要】 目的探讨颈动脉不稳定斑块发生的分子机制。方法从Array Express数据库下载基因表达谱数据E-MTAB-2055。该数据包含24例颈动脉不稳定斑块和24例稳定斑块组织,从中筛选差异基因,并通过富集分析获取与不稳定斑块有关的生物学过程和通路。同时,通过构建差异表达基因的生物网络来寻找与该疾病高度相关的风险模块,并用荧光定量PCR法检测五对不稳定斑块和斑块旁标本,验证风险模块中部分基因的差异表达。结果不稳定斑块中发生显著性差异表达变化的基因共有439个,其中上调基因为232个,下调基因为207个。涉及到的生物学过程和通路大部分与炎症和免疫应答有关。生物网络和模块分析提示CXCR4、VCL和TYROBP可能在不稳定斑块发生发展过程中发挥着重要作用。荧光定量PCR结果显示CXCR4和TYROBP基因表达情况与芯片数据分析结果一致。结论本研究比较完整地揭示了不稳定斑块差异表达谱特征和所涉及的生物学过程和信号通路,其中TYROBP可能是不稳定斑块发生发展进程中新的致病基因。
【英文摘要】 Objective To explore the molecular mechanism in the formation of unstable plaques. Methods The c DNA microarray E-MTAB-2055 was downloaded from Array Express database to screen the differentially expressed genes in 24 ruptured plaques against 24 stable plaques. Functional enrichment analysis was conducted to define the biological processes and pathways involved in disease progression. The protein-protein interaction network was constructed to identify the risk modules with close interactions. Five pairs of ...
【基金】 南方-哈佛“健康医疗云服务”平台关键技术创新、集成与应用(2013J4500040)
【更新日期】 2015-05-29
【分类号】 R543.5
【正文快照】 在全球范围内,心血管疾病是危害人类健康的主要疾病。在致残致死的心血管疾病中,75%以上是由动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)引起,故AS是心脑血管疾病发生的重要病理基础[1]。目前普遍认为AS是一种慢性、进展性、炎症性疾病,而明确AS的发病机制是防治心脑血管病的根本措施。?

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