研究2014年安徽省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿中分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsachivirus A 16,CVA16)毒株VP1区基因特征。收集安徽省2014年1月至11月期间413份HFMD患儿咽拭子标本接种敏感细胞分离肠道病毒,用荧光定量RT-PCR鉴定细胞培养物,对CVA16阳性培养物进行毒株VP1区RT-PCR扩增及核苷酸序列测定和基因特征分析,并与国内外参考序列构建基因亲缘性关系树。共分离鉴定出肠道病毒阳性培养物97份,其中CVA16病毒分离株17株,人肠道病毒71型(Human enterovirus 71,HEV71)分离株76株,其它肠道病毒分离株4株,总体病毒分离率为23.49%(97/413)。CVA16基因亲缘性关系分析显示:安徽省2014分离的17株CVA16毒株都属于B1基因型B1b一个分支,它们之间在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分布为分别为95.30%~100%和98.70%~100%,但在B1b分支内形成几个传播链。17株CVA16毒株VP1区核苷酸序列与国内云南、湖南、广东、西藏和江苏地区病毒分离株同源性较高,亲缘性...
【英文摘要】
To study on the phylogenetic characterization of the VP1 genes of coxsackievirus A16(CVA16)causing hand-food-mouth disease(HFMD)isolated from Anhui province in 2014.A total of 413 throat swab specimens from HFMD patients were collected during January to November,2014 for the isolation and identification of enteroviruses using real-time RT-PCR assays.The VP1 regions of CVA16 isolates were amplified using RT-PCR and sequenced.And the phylogenetic tree was constructed among the VP1 regions of those isolates,th...
【更新日期】
2015-12-22
【分类号】
R373.2
【正文快照】
手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种在儿童中常见的传染病,尤其对5岁以下幼儿易感,柯萨奇病毒A组16型(Coxsack-ievirus A16,CVA16)和人肠道病毒71型(Humanenterovirus 71,HEV71)已被证实为HFMD的两种主要病原体[1-2]。自2008年安徽阜阳HFMD大规模暴发以来,有文?
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