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甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析  
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【英文篇名】 Analysis of the Genetic Evolution of Neuraminidases of Influenza A Subtype N9 Viruses
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【作者】 万勇; 汤华;
【英文作者】 WAN Yong; TANG Hua; Tianjin Life Science Research Center and Department of Microbiology; School of Basic Medical Sciences; Tianjin Medical University; Centers for Disease Control and Prevention of Tianjin Heping District;
【作者单位】 天津医科大学生命科学中心实验室、基础医学院微生物学教研室; 天津市和平区疾病预防控制中心;
【文献出处】 病毒学报 , Chinese Journal of Virology, 编辑部邮箱 2015年 02期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 流感病毒; 神经氨酸酶; 基因进化;
【英文关键词】 Influenza virus; Neuraminidase; Genetic evolution;
【摘要】 通过对甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶(NA)核苷酸进化趋势的研究,进而探寻2013年新型H7N9亚型禽流感病毒产生的根源。本次研究选取美国国立生物技术信息中心(NCBI)的甲型N9亚型流感病毒的NA序列,采用生物软件ClustalX 2.0和MEGA 6.0建立进化树形图。对其欧亚分支,采用BEAST软件2.1.2和Datamonkey interface在线软件,计算和分析选择压力和进化速率。采用Bioedit软件对NA的氨基酸置换熵值计算并分析。系统进化树表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒可划分至现代欧亚分支之内,并且该分支的每位点每年核苷酸置换速率均值为3.8354×10-3,选择压力dN/dS均值为0.140413。16、19、40、53、81、84、112、256、335、359和401的氨基酸变异位点熵值>0.5。研究分析表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒的NA片段基因可能来自甲型N9亚型流感病毒逐步进化的结果,最早可追溯到1996年的A/duck/Siberia/700/1996(H11N9)流感毒株,新型H7N9亚型禽流感病毒来源不是来自外界环境压力引起突变的结果。
【英文摘要】 This study analyzed the genetic evolution of neuraminidases(NAs)of influenza A subtype N9 viruses with the aim of determining the genetic origin of the novel avian A/H7N9 influenza virus.The NA sequences of influenza A subtype N9 viruses available from NCBI were used to construct a phylogenetic tree using the programs ClustalX 2.0and MEGA 6.0.This analysis indicated that the novel avian A/H7N9 influenza virus is located in the modern Eurasian phylogenetic cluster.This cluster was then further analyzed by es...
【更新日期】 2015-04-22
【分类号】 R373.13
【正文快照】 流感病毒作为全世界范围内对人类健康存在影响的主要病原,由于其受环境压力的影响可导致抗原的漂移和抗原的转换,这些进化结果均可导致流感病毒大范围的流行。其中各片段之间的基因重排是其抗原转换的基础,这也是如1918年西班牙、1957年亚洲、1968年中国香港地区流感大流行的主

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