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芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用  
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【英文篇名】 Development and Application of Chloroplast Insertion/Delection Markers for Miscanthus Andersson
【下载频次】 ★★★
【作者】 薛宏; 易自力; 肖亮; 丁力; 彭思佳; 蒋建雄;
【英文作者】 XUE Hong; YI Zi-li; XIAO Liang; DING Li; PENG Si-jia; JIANG Jian-xiong; College of Bioscience & Biotechology; Hunan Agricultural University; The Sericultral Research Institute of Hunan Province;
【作者单位】 湖南农业大学生物科学技术学院; 湖南省蚕桑科学研究所;
【文献出处】 现代农业科技 , Modern Agricultural Science and Technology, 编辑部邮箱 2015年 07期  
期刊荣誉：ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 芒属植物; 叶绿体; InDel标记; 育种; 应用;
【英文关键词】 Miscanthus Anderss; chloroplast; In Del marker; breeding; application;
【摘要】 研究利用芒属植物(芒02381和荻04005)叶绿体全基因组测序的结果,开发12对InDel标记。采用正交设计法优化cpInDelPCR体系,得到模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶5个关键因素在体系中的最佳组合。12对InDel标记对43份芒属和2份甘蔗材料进行扩增,共扩增出538条条带,其中3对引物扩增出13条多态性条带,占总数的2.4%。将所有位点读带转化为数值矩阵并用UPGMA法聚类,在遗传相似系数1.4的水平上,和南荻聚为一类,而芒和与五节芒、双药芒、红山茅、尼泊尔芒、甘蔗聚为一类,4个具有杂交种特征的材料单独聚为一类。试验开发的芒属植物cpInDel标记可用于芒与荻的区分,指导芒属植物的杂交育种。
【英文摘要】 In this paper,we have sequenced the whole-genome of the Miscanthus(M.sinensis No.02381、M.sacchariflorus No.04005)chloroplast and developed 12 pairs of In Del markers.The orthogonal design was employed to optimize the cp In Del-PCR system,the best combination of the five key factors in this system,such as template DNA,d NTPs,Mg2 +,primers,Taq DNA polymerase were obtained.A list of 43 Miscanthus and 2 sugarcane materials were used to amplify by 12 pairs of In Del markers and 538 bands were amplified totally.1...
【基金】 863计划(2012AA10180104); 国家支撑计划(2013BAD22B01)
【更新日期】 2015-06-01
【分类号】 S578
【正文快照】 芒属(Miscanthus Andersson)植物作为第3代纤维素能源植物,因其生物质产量高、质量优良、种植成本低、适应能力强、生态效益好等特点而受到高度关注和广泛认可[1]。国内外对芒属植物的研究正从代表植物奇岗(M.x giganteus)向更加广阔的芒(M.sinensis)、荻(M.sacchariflorus)、?

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