茎瘤芥AP2/EREBP转录因子基因BjABR1的克隆和表达分析
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【英文篇名】
Cloning and Expression Analysis of an AP2/EREBP Transcription Factor Gene BjABR1 in Brassica juncea var. tumida
【下载频次】
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【作者】
向浏欣 ;
夏玉先 ;
蔡应繁 ;
付于银 ;
王小艳 ;
刘吉军 ;
【英文作者】
XIANG Liu-xin ;
XIA Yu-xian ;
CAI Ying-fan ;
FU Yu-yin ;
WANG Xiao-yan ;
LIU Ji-jun ;
Genetic Engineering Research Center ;
Chongqing University ;
College of Bioinformation ;
Chongqing University of Posts and Telecommunications ;
State Key Laboratory of Cotton Biology ;
College of Life Science ;
Henan University ;
【作者单位】
重庆大学基因工程研究中心 ;
重庆邮电大学生物信息学院 ;
河南大学生命科学学院棉花生物学国家重点实验室 ;
【文献出处】
园艺学报
, Acta Horticulturae Sinica , 编辑部邮箱
2014年 01期 期刊荣誉:中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 中国期刊方阵 CJFD收录刊
【中文关键词】
BjABR1 ;
茎瘤芥 ;
基因克隆 ;
表达分析 ;
转录因子 ;
【英文关键词】
BjABR1 ;
Brassica juncea ;
gene cloning ;
expression analysis ;
transcription factor ;
【摘要】
以茎瘤芥(Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee)‘永安’为材料,通过RACE和RT-PCR技术得到1个AP2/EREBP转录因子基因的cDNA全长序列和基因组DNA(gDNA)序列,该基因与拟南芥AtABR1基因的氨基酸序列相似性高达72%,因此命名为BjABR1(GenBank登录号:JQ713825.1)。BjABR1基因gDNA序列含1个内含子;cDNA序列全长1 514 bp,含有1个1 146 bp的开放阅读框(ORF),编码381个氨基酸;其推定编码的蛋白分子量为41.674 kD,等电点为9.11,具有14个磷酸化位点,含1个典型的AP2 DNA结合域和1个CMX-1基序。洋葱表皮细胞的瞬时表达显示,BjABR1蛋白定位于细胞核。荧光定量PCR分析结果表明,该基因在茎瘤芥不同发育时期的根、茎、叶中均有表达,但在根中表达量极高;在对茎瘤芥组培幼苗进行高盐、渗透压和低温3种非生物胁迫处理后发现,3种胁迫均能诱导该基因表达,但其对高盐的响应更为迅速。
【英文摘要】
The full length cDNA sequence and genomic DNA(gDNA)sequence of an AP2/EREBP transcription factor family gene were cloned from Brassica juncea var. tumida Tsen et Lee‘Yong'an'by RACE(rapid amplification of cDNA ends)and RT-PCR. Amino acid sequence alignment showed the gene shared 72% similarity with a known Arabidopsis thaliana AP2/EREBP family gene,AtABR1,named after BjABR1(GenBank accession No. JQ713825.1). BjABR1 gene contained one intron and putatively encoded 381 amino acids with the protein molecular m...
【基金】
国家自然科学基金项目(31071461);
重庆市科技攻关项目(CSTC,201lAB1095);
重庆市自然科学基金项目(CSTC,2011AB1095);
重庆市教委科学技术研究项目(CSTC,KJ130510,KJ110506,KJ130509,KJ130502)
【更新日期】
2014-05-05
【分类号】
S637.3
【正文快照】
APETALA2/ethylene responsive element-binding protein(AP2/EREBP)蛋白是植物中一类多基因家族转录因子,数量庞大,如拟南芥(Arabidopsis thaliana)中有147个AP2/EREBP基因(Feng etal.,2005),毛果杨(Populus trichocarpa)200个(Zhuang et al.,2008),水稻(Oryza sativa)163个(S
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