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甘蓝型油菜核心SSR引物筛选及指纹图谱构建  
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【英文篇名】 Screening of SSR Core Primers and Fingerprinting Construction of Brassica napus L.
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【作者】 赖运平; 王丽容; 何巧林; 张浙峰; 张新明; 堵苑苑; 余毅;
【英文作者】 LAI Yun-ping; WANG Li-rong; HE Qiao-lin; ZHANG Zhe-feng; ZHANG Xin-ming; DU Yuan-yuan; YU Yi; Crop Research Institute; Sichuan Academy of Agricultural Sciences/Chengdu Station for Testing Center of New Varieties of Plants; Ministry of Agriculture; College of Agronomy; Sichuan Agricultural University; Development Center of Science and Technology of Ministry of Agriculture;
【作者单位】 四川省农业科学院作物研究所/农业部植物新品种测试(成都)分中心; 四川农业大学农学院; 农业部科技发展中心;
【文献出处】 西南农业学报 , Southwest China Journal of Agricultural Sciences, 编辑部邮箱 2014年 06期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 甘蓝型油菜; 简单重复序列; 核心引物; 指纹图谱;
【英文关键词】 Brassica napus L.; Simple sequence repeat(SSR); Core primer; Fingerprinting;
【摘要】 为筛选一组适合甘蓝型油菜DNA指纹鉴定的核心SSR引物,进而构建甘蓝型油菜品种的SSR指纹图谱库,本研究采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对952对甘蓝型油菜SSR引物进行筛选。采用入选的核心引物,以等位变异大小形式,构建184份甘蓝型油菜品种的指纹图谱,并对影响等位变异大小的因素进行分析。综合考虑引物多态性信息含量(PIC)、条带清晰度、重复性及染色体分布,确定47对核心引物。结果表明,47对引物检测到51个位点,平均每条染色体2.6个,PIC值介于0.2314~0.9253,平均为0.6004。等位变异大小影响因素分析结果表明,荧光基团(6-FAM、HEX、ROX和TAMRA)对等位变异的影响介于0~5 bp,不同型号DNA分析仪的系统误差介于1~4 bp。本研究筛选的核心引物多态性丰富,可用于甘蓝型油菜品种鉴定及指纹图谱构建,不同批次样品指纹图谱的整合可采用参考品种DNA进行校正。
【英文摘要】 In order to determine a set of SSR core primers for DNA fingerprinting identification and construct SSR based fingerprinting database of Brassica napus L.,a total of 952 primers of Brassica napus L. were screened by 6 % denaturing polyacrylamide gel electrophoresis and capillary electrophoresis technique. Fingerprinting of 184 Brassica napus L. varieties were established by using selected core primers and allele size,and the factors which affected allele size were also explored in this study. Total of 47 co...
【基金】 公益性行业(农业)科技专项(200903008)
【更新日期】 2015-02-04
【分类号】 S565.4
【正文快照】 甘蓝型油菜是中国的重要油料经济作物,每年有大量品种参加国家、省级审定和特异性、一致性和稳定性(DUS)测试。据统计,2000-2012年,通过国家和省级审定的油菜品种897个,其中,甘蓝型油菜多达878个[1],中国公布的80种保护名录植物种类中,截止2013年12月,甘蓝型油菜的申请量为258?

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