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中国甲型流感病毒血凝素基因进化分析  
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【英文篇名】 Evolution of infl uenza A virus hemagglutinin gene in China
【下载频次】 ★★☆
【作者】 袁彦婷; 陈建威; 陆祖宏;
【英文作者】 YUAN Yan-ting; CHEN Jian-wei; LU Zu-hong; State Key Laboratory of Bioelectronics; School of Biological Science and Medical Engineering; Southeast University; Shenzhen BGI;
【作者单位】 东南大学生物电子学国家重点实验室; 深圳华大基因研究院;
【文献出处】 解放军医学院学报 , Academic Journal of Chinese PLA Medical School, 编辑部邮箱 2014年 09期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 甲型流感病毒; 群体遗传学; 血凝素基因; 进化;
【英文关键词】 influenza A virus; population genetics; hemagglutinin gene; evolution;
【摘要】 目的探索甲型流感的暴发规律及毒株血凝素(hemagglutinin,HA)基因的进化。方法通过分析中国采集并公布的甲型流感病毒基因数据,对中国大陆所有宿主为人、禽类和哺乳动物的HA基因氨基酸序列进行多序列比对,并用于构建HA的系统发育树,同时对中国香港地区的HA基因蛋白序列同样处理;分析不同宿主的HA基因的受选择压力。结果选择中国大陆1 252个HA基因和香港485个HA基因,对其分析发现,自2002年以来,禽流感的暴发次数和频率多于历史记录;系统发育树结果显示中国大陆和香港地的HA基因邻接树的拓扑结构一致;宿主为人的HA基因受选择大于禽类宿主的HA基因。结论不同宿主的HA基因受选择有差异,提示HA基因的快速进化可能会对人类健康产生潜在威胁。
【英文摘要】 Objective To study the outbreak rules of influenza A virus and the evolution of hemagglutinin(HA). Methods A phylogenetic tree of HA gene was constructed respectively for influenza A virus in China mainland and Hong Kong District of China to analyzed the influenza genome data published in China mainland and compare the HA gene sequences in humans, avian, and mammals in China mainland and Hong Kong District of China. The selection pressure of HA gene from different hosts were analyzed. Results The analysis o...
【更新日期】 2014-10-23
【分类号】 R511.7
【正文快照】 甲型流感病毒可在鸟类和哺乳动物中引起流行性感冒,根据其表面蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的不同,可以将甲型病毒分为多种亚型[1]。目前甲流病毒的血凝素(H)有18种亚型,神经氨酸酶(N)有11个亚型。禽流感就是甲型流感病毒的亚型。历史上几次世?

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