草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因vv-gpx01的序列特征及表达分析-中国学术期刊网络出版总库

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草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因vv-gpx01的序列特征及表达分析

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【英文篇名】	Sequence Characteristics and Expression Analysis of a Glutathione Peroxidase Gene vv-gpx01 from Volvariella volvacea
【下载频次】	★★★★☆
【作者】	严俊杰; 郭丽; 赵静静; 谢宝贵;
【英文作者】	YAN Jun-jie; GUO Li; ZHAO Jing-jing; XIE Bao-gui; Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University;
【作者单位】	福建农林大学菌物研究中心;
【文献出处】	吉林农业大学学报 , Journal of Jilin Agricultural University, 编辑部邮箱 2014年 05期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	草菇; 谷胱甘肽过氧化物酶; 可变剪接; 基因结构; 系统进化; 差异表达;
【英文关键词】	straw mushroom; glutathione peroxidase; alternative splicing; gene structure; phyletic evolution; differential expression;
【摘要】	依托草菇基因组及转录组数据,克隆得到1个谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)编码基因,命名为vvgpx01。ZOOM软件的分析结果表明:该基因全长1 313 bp,含有4个外显子、3个内含子,编码228个氨基酸;5'端非翻译区长为12 bp,3'端非翻译区为452 bp;其中3个内含子在RNA加工过程中均存在保留现象。生物信息学分析结果表明:草菇的GPx01序列具备完整的谷胱甘肽过氧化物酶保守结构域;系统发育树显示,担子菌与子囊菌的GPx分别聚在了2个不同的分支上,草菇GPx01与双孢蘑菇亲缘关系较近并与其他伞菌目的真菌聚在1个分支上。另外,由内含子保留所产生的氨基酸序列均出现了不同程度的功能域缺失,这将导致谷胱甘肽过氧化物酶的失活。表达谱分析结果表明:vv-gpx01在整个草菇生长阶段都有表达,但表达量存在差异。推测,草菇GPx01可能通过可变剪接产生不同的转录本,通过调节不同转录本的表达水平来调控基因功能域的翻译水平及空间构型,最终实现酶活性的调节。
【英文摘要】	Based on genome and transcriptome data of Volvariella volvacea,a gene encoding glutathione peroxidase(GPx) was cloned,and named as vv-gpx01.The results analyzed by ZOOM software showed that vv-gpx01 contained 1 313 bp,encoding a polypeptide of 228 amino acids.vvgpx01 gene contained 4 exons and 3 introns,5' UTR contained 12 bp,3' UTR contained 452 bp.And three intron retention alternative splicing sites were identified during RNA processing.The bioinformatics analysis showed GPx01 of Volvariella volvacea had...
【基金】	国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS24)
【更新日期】	2014-11-19
【分类号】	S646.13
【正文快照】	引文格式:严俊杰,郭丽,赵静静,等.草菇谷胱甘肽过氧化物酶编码基因vv-gpx01的序列特征及表达分析[J].吉林农业大学学报,2014,36(5):540-545.***通讯作者吉林农业大学学报Journal of Jilin Agricultural Universitythe missing of GSH peroxidase domain in different levels,wh

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