沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式-中国学术期刊网络出版总库

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沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式

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【英文篇名】	Bioinformatic Analysis and Expression Patterns under Abiotic Stresses of AmLEA5from Ammopiptanthus mongolicus
【下载频次】	★★★★★
【作者】	赵晓鑫; 刘美芹; 师静; 智冠华; 刘胜利; 张俊琦; 陈玉珍; 卢存福;
【英文作者】	ZHAO Xiao-xin; LIU Mei-qin; SHI Jing; ZHI Guan-hua; LIU Sheng-li; ZHANG Jun-qi; CHEN Yu-zhen; LU Cun-fu(College of Biological Sciences and Technology; National Engineering Laboratory for Tree Breeding; Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry; Beijing Forestry University; Beijing 100083);
【作者单位】	北京林业大学生物科学与技术学院/林木育种国家工程实验室/教育部林木花卉遗传育种重点实验室;
【文献出处】	植物遗传资源学报 , Journal of Plant Genetic Resources, 编辑部邮箱 2013年 03期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	沙冬青; AmLEA5; 生物信息学分析; 表达模式; 亚细胞定位;
【英文关键词】	Ammopiptanthus mongolicus; AmLEA5; bioinformatic analysis; expression pattern; subcellular localization;
【摘要】	对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。
【英文摘要】	Molecular characterization and expression patterns of AmLEA5(AAW31666.1) under abiotic stresses which cloned from cold-and drought-stressed Ammopiptanthus mongolicus by a modified solid subtractive hybridization method were reported in this study.Bioinformatic analysis showed that the gene encoded a group 5 late embryogenesis abundant protein(LEA).The overall length of AmLEA5 was 693 bp,and the cDNA contained a 297 bp ORF encoding a polypeptide of 98 amino acids with a calculated molecular mass of 10.6 kDa....
【基金】	国家自然科学基金(31270737,30671476); 北京市自然科学基金(6112016)
【更新日期】	2013-06-05
【分类号】	S793.9
【正文快照】	胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA,Late embryogen-esis abundant proteins)最早发现于棉花子叶中[1],随后在小麦[2]、大豆[3]、玉米[4]等作物种子中陆续被发现。LEA蛋白在被子植物、裸子植物,以及苔藓和蕨类植物中都存在,此外在酵母、线虫等物种中也表达[5]。在植物中,它伴随着种子的

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