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Tamura模型下DNA序列点突变熵性质的研究  
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【英文篇名】 Entropy properties of the point mutations in DNA sequence using Tamura model
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【作者】 郭子湖; 张瑞明; 袁志发;
【英文作者】 GUO Zi-hu; ZHANG Rui-ming; YUAN Zhi-fa(Institute of Applied Mathematics; College of Science; Northwest A&F University; Yangling; Shaanxi 712100; China);
【作者单位】 西北农林科技大学理学院应用数学研究所;
【文献出处】 西北农林科技大学学报(自然科学版) , Journal of Northwest A & F University(Natural Science Edition), 编辑部邮箱 2013年 02期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 生物多样性; Shannon信息熵; 核苷酸替换; Tamura模型;
【英文关键词】 biodiversity; Shannon entropy; nucleotide substitution; Tamura model;
【摘要】 【目的】研究在较复杂的核苷酸替换模型,即Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸频率随世代变化的规律,以得到序列熵的性质,为了解生物进化机理奠定基础。【方法】在Shannon信息熵理论基础上,利用La-grange乘数法进行理论证明,并用Mathematica软件模拟了Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸组成的变化规律和序列熵的变化过程。【结果】DNA序列在Tamura模型下发生突变,各核苷酸频率随世代变化逐渐趋于平衡,且序列熵趋于最大值。【结论】核苷酸突变具有保熵性,验证了前人生物是朝着多样性增大的方向发展进化的结论。
【英文摘要】 【Objective】 The changing of the frequencies of 4 nucleotides as the generations changed using Tamura model,which is a more complicated nucleotide substitution model,was studied to obtain the entropy properties of DNA sequences.【Method】 Based on Shannon entropy theory,the theoretical demonstration was proved by the Lagrange Multiplier Method,and Mathematica was used to simulate the changing patterns of 4 nucleotides.【Result】 If the mutation in the DNA sequence occurs in Tamura model,the frequencies of nucleo...
【基金】 西北农林科技大学引进人才科研启动费项目(Z11021105)
【更新日期】 2013-04-10
【分类号】 Q16
【正文快照】 生物要在复杂多变的环境中生存,就必须具有多样性。因此,遗传多样性的存在是生物进化的基础。这正是达尔文关于生物由简单到复杂、由低级到高级逐渐进化理论的核心所在,即生物进化是生物为适应环境压力而保持或改变成新的多样性的过程[1-2]。生物多样性通常体现在DNA序列一级结

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