牙菌斑培养菌群宏基因组文库构建及抗生素耐药基因筛选-中国学术期刊网络出版总库

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牙菌斑培养菌群宏基因组文库构建及抗生素耐药基因筛选

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【英文篇名】	Screening antibiotic resistance genes of cultured dental plaque with a metagenomic approach
【下载频次】	★★★★★
【作者】	吴丹; 程功; 李晶; 朱宝利; 魏世成;
【英文作者】	WU Dan 1 CHENG Gong 2 LI Jing 2 ZHU Bao-Li 2 WEI Shi-Cheng 1(1.Laboratory of Interdisciplinary Studies; School and Hospital of Stomatology; Peking University; Beijing 100081; China)(2.CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology; Institute of Microbiology; Chinese Academy of Sciences; Beijing 100101; China);
【作者单位】	北京大学口腔医学院口腔交叉学科实验室; 中国科学院微生物研究所环境微生物基因组中心;
【文献出处】	微生物学通报 , Microbiology China, 编辑部邮箱 2013年 06期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊中国期刊方阵 CJFD收录刊
【中文关键词】	牙菌斑生物膜; 宏基因组; Fosmid文库; 抗生素耐药;
【英文关键词】	Oral microbiota; Metagenomics; Fosmid library; Antibiotic resistance;
【摘要】	【目的】构建牙菌斑培养菌群宏基因组文库,筛选牙菌斑生物膜中细菌的抗生素耐药基因。【方法】采集20例无龋健康人的集合牙菌斑并进行厌氧培养。提取牙菌斑培养菌群宏基因组构建Fosmid文库。用卡那霉素、四环素及氨苄西林对文库进行筛选,并对筛选到的抗性Fosmid克隆进行末端测序、亚克隆构建、亚克隆测序和序列分析。【结果】构建了牙菌斑培养菌群宏基因组Fosmid文库,插入片段长度在36 48 kb间约有15 120个克隆,插入片段长度小于36 kb的约有3 360个克隆。筛选获得一个氨基糖苷类双功能修饰酶AacA-AphD基因、一个核糖体保护蛋白型四环素耐药基因tet(M)及一个C家族-内酰胺酶基因。【结论】证实了可以通过构建宏基因组文库的方法来筛选牙菌斑培养菌群中的抗生素耐药基因。
【英文摘要】	[Objective] Fosmid library of cultured human dental plaque samples was constructed and screened for antibiotic resistance genes.[Methods] Dental plaques from 20 individuals were obtained and cultured anaerobically in vitro.Bacteria DNA was extracted and Fosmid library was constructed.Antibiotic resistant clones were selected by plating on LB agar containing one of the three antibiotics: kanamycin,tetracycline,and ampicillin.Inserts conferring resistance were sequenced and annotated.[Results] A metagenomic F...
【基金】	国家自然科学基金项目(No.30973317)
【更新日期】	2013-07-03
【分类号】	Q93
【正文快照】	抗生素的发现和应用使人类的平均寿命延长了23年以上[1],然而,随着抗菌药物的不断发展与应用,病原菌对常用抗菌药物的耐药性也不断增加。病原菌的耐药严重地威胁着人类身体健康,细菌耐药问题也日益受到人们的重视,成为全球关注的热点[2 3]。在以抗生素耐药基因为切入点的研究中

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