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miR-138靶基因hTERT的生物信息学预测及鉴定

Prediction and identification of target gene hTERT of miR-138 with bioinformatics technique

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【作者】 陈陵陈先华梁光萍范亚川王国威宋航邹利全

【Author】 CHEN Ling;CHEN Xian-hua;LIANG Guang-ping;Department of Gastroenterology,324 Hospital of PLA;Institute of Burn Research,Southwest Hospital,Third Military Medical University;

【机构】 中国人民解放军第三二四医院消化内科中国人民解放军第三军医大学西南医院烧伤研究所

【摘要】 目的预测并鉴定miR-138的靶基因人端粒酶反转录酶(human telomerase reverse transcriptase,hTERT)。方法采用生物信息学技术,预测miR-138与hTERT 3’UTR结合位点及结合后稳定性。分别采用RTqPCR、Western blot技术检测过表达miR-138后MKN-45细胞内hTERT在mRNA与蛋白水平的变化。采用双荧光素酶实验及突变实验,验证miR-138与hTERT mRNA的结合位点。结果生物信息学技术预测显示,miR-138可稳定结合于hTERT 3’UTR。miR-138过表达后可明显抑制MKN-45细胞内hTERT蛋白表达水平(P<0.01),但对hTERT mRNA水平无显著影响(P>0.05)。双荧光素酶实验证实miR-138可稳定结合于hTERT 3’UTR相应位点。结论 miR-138通过直接结合于靶基因hTERT 3’UTR抑制hTERT蛋白表达。miR-138可能成为基于miRNA的肿瘤基因治疗的新靶标。

【Abstract】 Objective To predict and identify the target gene human telomerase reverse transcriptase( hTERT) of miR-138. Methods The bioinformatics analysis was employed to predict miR-138 binding sites with hTERT 3’UTR. RT-qPCR and Western-blot were used to examine the inhibitory effect on hTERT in human gastric carcinoma MKN-45 cells by miR-138. Furthermore,the binding site of miR-138 to hTERT 3’ UTR was examined using dual luciferase reporter assay. Results The bioinformatics analysis showed stable binding site of miR-138 and hTERT 3’UTR. Over-expression of miR-138 in MKN-45 cells significantly suppressed the expression of hTERT protein( P < 0. 01),but not hTERT mRNA( P > 0. 05). The dual luciferase reporter assay verified the binding site of miR-138 to hTERT 3’UTR. Conclusion miR-138 can stably bind to hTERT 3’UTR and suppress the hTERT expression,which makes miR-138 a promising target in cancer gene therapy.

【基金】 国家自然科学基金(30900679);重庆市自然科学基金资助(cstc2011jjA10111;cstc2011jjA10114;cstc2012 jjA10145)
  • 【文献出处】 实用肿瘤杂志 ,Journal of Practical Oncology , 编辑部邮箱 ,2013年06期
  • 【分类号】R730.2
  • 【被引频次】1
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