一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法-中国学术期刊网络出版总库

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一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法

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【英文篇名】	Novel approach to prediction of protein subcellular localization
【下载频次】	★★★★★
【作者】	程昔恩; 吴志诚;
【英文作者】	CHENG Xien; WU Zhicheng Information Engineering School; Jingdezhen Ceramic Institute; Jingdezhen; Jiangxi 333403; China;
【作者单位】	景德镇陶瓷学院信息工程学院;
【文献出处】	计算机工程与应用 , Computer Engineering and Applications, 编辑部邮箱 2012年 06期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊中国期刊方阵 CJFD收录刊
【中文关键词】	蛋白质亚细胞定位; 多标记学习; Gene Ontology; 最近邻算法;
【英文关键词】	protein subcellular localization; multi-label learning; Gene Ontology; k-nearest neighbors algorithm;
【摘要】	蛋白质亚细胞定位是蛋白质组学基本问题之一。某些类型蛋白质可能存在于两个或两个以上的亚细胞位置,这类蛋白质的亚细胞定位问题更为复杂。分别利用Gene Ontology和伪氨基酸成分法,将一条蛋白质表示为一实值向量;采纳多标记学习中的Ranking思想,计算出一得分向量V,该向量的每一分量的值表示被预测蛋白质属于某个亚细胞位置的概率;利用最近邻算法预测蛋白质所属亚细胞位置的个数n,得分向量V中得分最高的n个分量对应的亚细胞位置即为预测的位置。
【英文摘要】	It is one of basic problems of proteomics to identify the subcellular locations of a protein.It makes the problem more compli- cated that some proteins may simultaneously exist in two or more than two subcellular locations.Gene Ontology and pseudo amino ac- id composition are respectively employed to represent a protein as a real values vector.The idea of Ranking initiating from multi-label learning community is adopted to compute a score vector V,each component value of which indicates the probability that...
【基金】	国家自然科学基金(No.60961003); 江西省自然科学基金(No.2010GQS0127)
【更新日期】	2012-03-13
【分类号】	Q51;TP392
【正文快照】	1概述细胞是一个高度有序的结构,其内部细分为多种细胞器,诸如细胞核、细胞壁、核糖体、线粒体、高尔基体等,这些细胞器统称为亚细胞位置。蛋白质是细胞最重要的组成物质之一。一种蛋白质只有在特定的亚细胞位置内,其功能才能正常表达,否则生物体就会发生严重功能缺失或紊乱。?

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