寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析-中国学术期刊网络出版总库

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寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析

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【英文篇名】	Analysis of the regulation network of microRNA targets in Arabidopsis thalianainfected with Phytophthora parasitica
【下载频次】	★★★★★
【作者】	张伟; 徐珂; 王秦虎; 王晓龙; 单卫星;
【英文作者】	ZHANG Weia; XU Kea; WANG Qin-hua; WANG Xiao-longa; SHAN Wei-xingb; c(a College of Life Sciences; b College of Plant Protection; c State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas; Northwest A&F University; Yangling; Shaanxi 712100; China);
【作者单位】	西北农林科技大学生命科学学院; 西北农林科技大学植物保护学院; 西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室;
【文献出处】	西北农林科技大学学报(自然科学版) , Journal of Northwest A & F University(Natural Science Edition), 编辑部邮箱 2011年 12期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊中国期刊方阵 CJFD收录刊
【中文关键词】	MicroRNA; 生物胁迫; 调控网络; GO分析;
【英文关键词】	microRNA; biotic stress; regulation network; GO analysis;
【摘要】	【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,为探明microRNA对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(Phytophthora parasitica)和模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,构建其靶标调控网络,并进行Gene Ontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的Solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microRNA,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;Gene Ontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microRNA靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。
【英文摘要】	【Objective】 We analyzed the microRNAs of Arabidopsis in response to infection by Phytophthora parasitica,to understand microRNA targets regulation network,potential pathological and biological roles in processes of response to challenged by infection.【Method】 The compatible Phytophthora parasitica-Arabidopsis thaliana pathosystem was employed to identify plant microRNAs in response to pathogen infection,to construct the target genes regulation networks,and to perform Gene Ontology and domain enrichment anal...
【基金】	国家“863”计划项目(2008AA02Z110)
【更新日期】	2011-12-23
【分类号】	S432.4
【正文快照】	microRNA(miRNA)是真核生物和部分病毒体内普遍存在的长度为21～24nt的内源性非编码单链小分子RNA[1]。miRNA由内源的MIRNA基因编码产生,通过与靶基因的mRNA结合,在转录后水平介导靶基因mRNA的降解或抑制其翻译,对基因表达进行调控[2]。1993年,Lee等[3]通过遗传分析方法在秀丽?

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