基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性
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【英文篇名】
GENETIC DIVERSITY EVALUATION BY THE COMPARATIVE ANALYSIS ON MITOCHONDRIAL D-LOOP AREA BETWEEN WILD AND CULTURED POPULATIONS OF HAPALOGENYS NITENS
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【作者】
陈竹 ;
钟山 ;
罗大极 ;
杨国华 ;
梁日深 ;
邹记兴 ;
【英文作者】
CHEN Zhu1 ;
ZHONG Shan1 ;
LUO Da-Ji1 ;
YANG Guo-Hua1 ;
LIANG Ri-Shen2 and ZOU Ji-Xing2(1.Department of Genetics ;
Wuhan University ;
Wuhan 430071 ;
China ;
2.Department of Aquiculture ;
College of Animal Science ;
South China Agricultural University ;
Guangzhou 510642 ;
China) ;
【作者单位】
武汉大学遗传学系 ;
华南农业大学动物科学学院 ;
【文献出处】
水生生物学报
, Acta Hydrobiologica Sinica , 编辑部邮箱
2011年 05期 期刊荣誉:中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 中国期刊方阵 CJFD收录刊
【中文关键词】
斜带髭鲷 ;
线粒体基因组 ;
D-loop ;
基因多态性 ;
【英文关键词】
Hapalogenys nitens ;
Mitochondrial genome ;
D-loop ;
Genetic diversity ;
【摘要】
采集广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷Hapalogenys nitens(Richardson)和养殖斜带髭鲷各25个样本。通过设计特异性引物,采用PCR技术对该50个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,测序得到的序列进行比对,发现该50个序列长度变异较小,均在788—790 bp之间,野生型和养殖型区别不大。采用MEGA(version 4.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示:50条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为29.9%、21.5%、35.2%和13.5%,其中A+T的含量(65.1%)显著高于G+C含量(34.9%),表现了明显的碱基偏倚。50个个体表现为26种单倍型,包括91个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.024,单倍型多态性(h)为0.958,核苷酸多态性(π)值为0.02277。研究表明,mtDNA D-loop区可以作为检测野生与养殖斜带髭鲷群体遗传多样性的有效分子标记,而广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷种群遗传多样性已经下降至中等水平。研究提示野生斜带髭鲷种群遗传多样性不容乐观,资源调查、种质维护与遗传评价有待深入。
【英文摘要】
Hapalogenys nitens is a kind of delicious marine fish,mainly distributes in China,Japan and Korea,which has become an important culture fish in China.In recent years,as economic activity is becoming more frequent,fewer and fewer natural nitens could be captured in Guangdong,Fujian,Zhejiang and other provinces along the coast.It is important to analyze the population genetic structure of Hapalogenys nitens.For evaluating the genetic diversity of Hapalogenys nitens,50 individuals of Hapalogenys nitens were co...
【基金】
国家自然科学基金项目(编号:3077165230972258)资助
【更新日期】
2011-09-16
【分类号】
S917.4
【正文快照】
斜带髭鲷Hapalogenys nitens(Richardson),俗称“包公鱼”,分类上隶属鲈形目Perciformes、石鲈科Pamadasyidae、髭鲷属Hapalogenys,是一种优质的食用海水鱼,生长快(当年能上市)、无肋间刺、肉味鲜美等优点而倍受养殖户和消费者青睐。斜带髭鲷运输途中成活率高,市场需求量大,因?
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