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弱精子症相关基因的生物信息学研究

Differentially expressed genes in asthenospermia:A bioinformatics-based study

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【作者】 毛向明邢荣威景晓玮周其赵余庆锋郭文彬武小强褚庆军冯春琼

【Author】 MAO Xiang-ming1,XING Rong-wei2,JING Xiao-wei1,ZHOU Qi-zhao3,YU Qing-feng1,GUO Wen-bin1,WU Xiao-qiang1,CHU Qing-jun4,FENG Chun-qiong51.Department of Urology,Nanfang Hospital;3.Department of Urology,The Third Affiliated Hospital;4.Center of Reproductive Medicine,Nanfang Hospital;5.Research Institute of Genetic Engineering,Southern Medical University,Guangzhou,Guangdong 510515,China;2.Department of Urology,Weihai Hospital,Qingdao University Medical College,Weihai,Shandong 264200,China

【机构】 南方医科大学南方医院泌尿外科青岛大学医学院附属威海医院泌尿外科南方医科大学附属第三医院泌尿外科南方医科大学南方医院生殖中心南方医科大学基因工程研究所

【摘要】 目的:研究弱精子症特异表达基因,加深对弱精子症发生分子机制的认识。方法:采用GATHER、PANTHER以及ToppGene在线生物信息学分析工具,对弱精子症差异表达基因进行生物信息学分析挖掘。结果:通过上述生物信息学软件分析发现,弱精子症差异表达基因在细胞蛋白质及大分子生物代谢过程、蛋白修饰、细胞死亡、细胞凋亡以及凋亡介导中发挥着重要作用。结论:通过生物信息学挖掘发现弱精子症患者精子在活力下降的同时,精子的基本生命活动也下降,同时更易于发生凋亡或死亡。参与细胞骨架构成、微管运动、细胞运动的一些差异表达基因,如KIF3B、MYO15A、KIF6、KIF26B、KIF3A、DNHD2、DMN、DYNC2H1、STARD9、MYOHD1、TPM1等,可能与弱精子症相关,值得进一步深入研究。

【Abstract】 Objective: To study the differentially expressed genes in asthenospermia to gain a deeper insight into the molecular mechanisms of the disease.Methods: We analyzed the differentially expressed genes in asthenospermia using GATHER,PANTHER and ToppGene online bioinformatics tools.Results: Our bioinformatics mining and analyses revealed that the differentially expressed genes in asthenospermia played important roles in the cellular protein and macromolecular metabolism,protein modification,cell death,cell apoptosis and apoptosis induction.Conclusion: Asthenospermia patients experience a decline in sperm activity and the basic life activities of sperm simultaneously,and are also prone to cell apoptosis or death.Such differentially expressed genes as KIF3B,MYO15A,KIF6,KIF26B,KIF3A,DNHD2,DMN,DYNC2H1,STARD9,MYOHD1,and TPM1,which are involved in cytoskeletal structure,microtubule movement and cell movement,may be associated with asthenospermia,and therefore deserve further studies.

【关键词】 精子弱精子症生物信息学基因芯片基因
【Key words】 spermasthenospermiabioinformaticsgene chipgene
【基金】 国家自然科学基金(30772167);广东省科技计划项目(2010B031600092);广东省医学科研基金(A2010358);南方医院院长基金(2009Z002)~~
  • 【文献出处】 中华男科学杂志 ,National Journal of Andrology , 编辑部邮箱 ,2011年08期
  • 【分类号】R698.2
  • 【被引频次】9
  • 【下载频次】435
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