节点文献

江西7种蛇类基于16S rRNA基因的DNA条形码构建

Initially study of the 16 S rRNA gene in DNA barcoding for snakes from JIANGXI

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 邓立彬; 汤晓丽; 邵建明; 熊志勇; 熊家强; 熊丹群; 方进; 龙飞; 陈极光; 肖俐; 汪雁;

【Author】 DENG Li-bin1b,2,TANG Xiao-li1b,SHAO Jian-ming2,XIONG Zhi-yong1c, XIONG Dan-qun1c, FANG Jing1a,LONG Fei1a,CHEN Ji-guang1a,XIAO Li1a,WANG Yan1a (1a.Faculty of Basic Medical Science; 1b.First Clinical Medical College; 1c.Laboratory Center of Medicine,Nanchang University,Nanchang 330006,China; 2.Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100029,China)

【机构】 南昌大学基础医学院; 中国科学院北京基因组研究所; 南昌大学第一临床医学院; 南昌大学医学实验教学部;

【摘要】 采用新设计COI、16S、CR3种线粒体基因(位点)的简并引物,对江西地区常见蛇类(2科6属7种)共20个个体样本进行了DNA条形码分析的初步尝试,将实验结果结合GenBank部分蛇类序列数据分析表明,在本实验涉及的蛇类个体及类群的识别上,16S rRNA基因片段合乎通用条码标记的序列的要求;且本实验设计的16S简并引物有适用性强、宽容度大的优势。其次,本研究结果支持"16S rRNA基因至少应该作为脊椎动物标准条码标记———线粒体COI基因不可缺少的补充"观点;提示当前对DNA条形码在不同生物类群的应用方面,尚待在更大的标本样品数量及更多不同基因片段序列数据的支撑。

【Abstract】 Referred to snake sequence data from GenBank,and studied 20 samples of snakes in Nanchang,which include 2 families,6 genus,and 7 species,to present a first attempt in applying the usage of DNA barcode in the species of snakes.Our experiment demonstrates,in terms of identifying snakes samples or groups,mitochondrial 16S rRNA gene fulfills the requirements for a universal DNA barcoding marker;we also show certain advantage in the application and universality of combination.Furthermore,our result supports the opinion:"We strongly advocate the use of 16S rRNA as standard DNA barcoding marker for vertebrates to complement COI,especially if samples a priori could belong to various phylogenetically distant taxa and false negatives would constitute a major problem."(Miguel et a1.2005).we recommend richer species samples and larger various gene sequences to support a wider application of DNA barcode in different biological field.

【关键词】 16S rRNA基因; 蛇类; DNA条形码;
【Key words】 16S rRNA gene; snake; DNA barcoding;
【基金】 国家自然科学基金资助项目(30871348);南昌大学科研基金资助项目(Z04812);南昌大学大学生创新性实验计划项目(2010)
  • 【文献出处】 南昌大学学报(理科版) ,Journal of Nanchang University(Natural Science) , 编辑部邮箱 ,2011年01期
  • 【分类号】Q75
  • 【被引频次】13
  • 【下载频次】349
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络