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邻菲罗啉衍生物与G-四链体DNA的识别

Recognition of phenanthroline derivative for G-quadruplex DNA

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【作者】 张美英王立华魏春英

【Author】 ZHANG Mei-ying,WANG Li-hua,WEI Chun-ying(Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering of Ministry of Education,Institute of Molecular Science,Shanxi University,Taiyuan 030006,China)

【机构】 山西大学化学与生物工程教育部重点实验室分子科学研究所

【摘要】 设计合成了一种新型邻菲罗啉衍生物,用IR1,H-NMR1,3 C-NMR和质谱进行了结构表征。在包含100mM NaCl的Tris-HCl(pH 7.4)缓冲溶液中,利用荧光共振能量转移熔点(FRET-melting)分析以及紫外可见光谱研究了此化合物对人端粒G-四链体DNA(AG3(T2AG3)3)的稳定作用。发现2.0μM的化合物可以使G-四链体的熔点温度升高(ΔTm)7.9 oC,表明新合成的化合物具有识别并稳定人端粒G-四链体DNA的作用,二者的结合常数为(2.0±0.06)×106 M-1。

【Abstract】 A new phenanthroline derivative was synthesized and the product was characterized by means of IR,1H-NMR,13C-NMR and ESI-MS spectrometries.Stabilization effect of the target compound on the human telomeric G-quadruplex DNA(AG3(T2AG3)3) was further studied using FRET melting assay and UV-visible spectra in 10 mM Tris-HCl buffer(pH 7.4) containing 100 mM NaCl.The result showed an increase in the melting temperature(ΔTm) of 7.9 oC for G-quadruplex in the presence of 2.0 μM compound,suggesting that this compound can recognize and stabilize G-quadruplex structure,and their association constant is(2.0±0.06)×106 M-1.

【关键词】 G-四链体邻菲罗啉相互作用
【Key words】 G-quadruplexphenanthrolineinteraction
【基金】 国家自然科学基金(21041008);山西省自然科学基金(2009011032-2);山西省回国留学人员科研资助项目(2007),山西省回国留学择优资助项目(2010);山西省研究生创新基金(2010)资助项目
  • 【文献出处】 化学研究与应用 ,Chemical Research and Application , 编辑部邮箱 ,2011年03期
  • 【分类号】R346
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】441
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