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α_(1A)-肾上腺素受体的同源模建及其对接研究  
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【英文篇名】 Homology modeling and docking research of Human α_(1A)-Adrenoceptors
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【作者】 赵鑫; 黄碧云; 袁牧; 季红; 朱柳;
【英文作者】 ZHAO Xin1; 2; HUANG Bi-yun1; YUAN Mu; 1; JI Hong1; ZHU Liu1(1.Pharmaceutical Research Center; Guangzhou Medical College; Guangzhou 510182; China; 2.Department of Food and Bioengineering; Guangdong Industry Technical College; Guangzhou 510300; China);
【作者单位】 广州医学院药物研究中心; 广东轻工职业技术学院食品与生物工程系;
【文献出处】 分子科学学报 , Journal of Molecular Science, 编辑部邮箱 2011年 06期  
期刊荣誉:ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 α1A-肾上腺素受体; 同源模建; 分子动力学; 对接; 激动剂和拮抗剂;
【英文关键词】 α1A-adrenoceptors; homology modeling; molecular dynamics; molecular docking; agonist and antagonist;
【摘要】 以β2肾上腺素受体(2β-AR)为模板,采用同源模建和分子动力学模拟构建了人类α1A-肾上腺素受体(α1A-AR)的三维结构模型,并利用PROCHECK,PROSA和WHAT-IF评估了模型的合理性.所得的结构采用分子对接程序Flexidock与激动剂去甲肾上腺素和拮抗剂西罗多辛分别进行对接,结果表明,2种配基具有相似的结合位点,配体可与同源模型的氨基酸残基Asp 106,Ser 188和Ser 192产生氢键作用,进一步证实了模型的合理性.研究结果对于基于受体的α1-AR的激动剂和拮抗剂的药物开发具有理论指导意义.
【英文摘要】 The three dimensional structure of human α1A-Adrenoceptors was modeled and refined using homology modeling and molecular dynamics simulation.The model was assessed by PROCHECK,PROSA and WHAT-IF methods,which confirmed that the obtained model was reliable.An agonist norepinephrine and an antagonist silodosin were docked into the refined structure by the molecular docking programs Flexidock.The results showed that the two ligands shared the similar binding cavity,which interact with the residues Asp106,Ser188...
【基金】 广州市科技计划重大专项资助(批准号:2009A1-E011-7)
【更新日期】 2012-01-16
【分类号】 R341
【正文快照】 α1-肾上腺素受体(α1-AR)是G蛋白偶联受体(GPCR)家族中的重要成员,是细胞膜信号传递过程中起重要作用的一类膜蛋白分子.克隆研究表明,α1-AR可分为α1A,α1B和α1D3种亚型[1],它们在组织分布,生化特性和生理功能方面完全不同.α1A-AR大量存在于泌尿系统(US)、中枢神经系统(CNS

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