节点文献

阿霉素水溶液的结构特征和氢键相互作用

Hydrogen Bonding and Structural Characteristics of Aqueous Solution of Adriamycin

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 朱素华严六明纪晓波陆文聪

【Author】 ZHU Su-hua1,3, YAN Liu-ming2, JI Xiao-bo1, LU Wen-cong2 (1.College of Material Science and Engineering, Shanghai 200444, China; 2.Department of Chemistry, College of Sciences, Shanghai University, Shanghai 200444, China; 3.Jiangsu Laboratory of Advanced Functional Materials and School of Physics and Electronics Engineering, Changshu Institute of Technology, Changshu 215500,China)

【机构】 上海大学材料科学与工程学院常熟理工学院江苏省新型功能材料省重点建设实验室上海大学理学院化学系

【摘要】 用密度泛函方法和分子动力学模拟方法详细研究了具有高效、广谱特点的蒽环类非细胞周期特异性抗肿瘤抗生素阿霉素水溶液的结构特征及其氢键相互作用.其中,密度泛函方法用于优化阿霉素分子的结构,获得用于分子动力学模拟的平衡结构和组成原子的残余电荷;分子动力学模拟研究溶液中阿霉素极性基团周围的水分布.结果表明,阿霉素周围平均约有10.26个水分子与其极性基团形成氢键;其中,作为质子受体形成7.23个氢键,作为质子供体形成3.03个氢键.由于阿霉素极性基团周围的环境不同,与水的相互作用特性不同:作为质子给体形成氢键的是氨基糖苷上的羟基和氨基,其他极性基团只作为质子受体形成氢键.这些极性基团形成氢键的强度顺序为:位于氨基糖苷的羟基和氨基>醌环羰基和D环烷氧基>B环羟基和A环侧链.

【Abstract】 Ab initio calculations and restrained all-atom molecular dynamics simulations are carried out to study the structural characteristics and the hydrogen-bonds of the aqueous solution of adriamycin, which is a broad spectrum and highly toxic non-specific anticancer antibiotics. On average, each adriamycin molecule forms about 10.26 hydrogen bonds with water molecules in aqueous solution, including 7.23 hydrogen bond accepters and 3.03 hydrogen bond donors. The strength order of the hydrogen bonds between water and adriamycin functional groups is: ammonium and hydroxyl of the amino glycoside>methoxyl and quinone oxygen of C and D rings>hydroxyls and carbonyl of the A and B rings.

【基金】 上海市教委项目;上海市教委E研究院;上海市重点学科建设项目(No.J50101);上海高校网格项目(No.20030301);上海市青年教师科研启动基金(QZ070)资助项目
  • 【文献出处】 常熟理工学院学报 ,Journal of Changshu Institute of Technology , 编辑部邮箱 ,2010年04期
  • 【分类号】O621.1
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】277
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络