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nanoLC-ESI/MS/MS在ECV304细胞蛋白质组学研究中的应用
Proteome analysis of ECV304 by nanoLC-ESI/MS/MS
【摘要】 目的:应用纳升液联用技术(nanoLC-ESI/MS/MS)对ECV304细胞蛋白质组学进行初步分析。方法:提取ECV304细胞总蛋白,经变性、还原、烷基化和酶解,nanoLC-ESI/MS/MS对酶解后的肽段进行分析,数据库(Swissprot)检索鉴定蛋白质,生物信息学工具对所鉴定的蛋白质进行细胞定位和功能分类。结果:从8μg细胞总蛋白中鉴定了120种蛋白质,所鉴定蛋白质的分子质量(MW)范围从6 648 D至280 739 D,MW<20 kD的蛋白质占24.2%,MW>100 kD的蛋白质占5.0%;主要位于细胞质、细胞骨架、细胞核和细胞膜,分别为27.8%、19.0%、15.2%和10.1%;大多为结构蛋白质和催化活性的蛋白质,分别为36.4%和34.1%,具有信号转导活性的占11.4%;其中角蛋白8、18和vimentin等为内皮细胞特异表达的蛋白质。结论:本研究建立了nanoLC-ESI/MS/MS分析ECV304细胞的蛋白质组学方法,为内皮细胞及内皮细胞损伤机制的蛋白质组学研究奠定了实验基础。
【关键词】 nanoLC-ESI/MS/MS技术;
ECV304细胞;
蛋白质组;
【Key words】 nanoLC-ESI/MS/MS technology; ECV 304 cells; Proteome;
【Key words】 nanoLC-ESI/MS/MS technology; ECV 304 cells; Proteome;
【基金】 国家自然科学基金面上资助项目(No.30600587);暨南大学引进人才启动基金资助项目(No.51205066)
- 【文献出处】 中国病理生理杂志 ,Chinese Journal of Pathophysiology , 编辑部邮箱 ,2009年01期
- 【分类号】R341
- 【被引频次】6
- 【下载频次】414