节点文献

GSEA在全基因组表达谱芯片数据分析中的应用

The Application of GSEA in Data Analysis of Genome Microarray

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 冯春琼邹亚光周其赵李铁求梁爽毛向明

【Author】 FENG Chun-qiong1,ZOU Ya-guang2,ZHOU Qi-zhao3,LI Tie-qiu3,LIANG Shuang1,MAO Xiang-ming3(1 Institute of Genetic Engineering;2 Department of stomatology;3 Department of Urology,Nan fang Hospital;Southern Medical University,Guang zhou 510515,China)

【机构】 南方医科大学基因工程研究所南方医科大学南方医院口腔科南方医院泌尿外科

【摘要】 GSEA是一个可下载后免费使用的全基因组表达谱芯片数据分析工具。它根据已有的对基因的定位、性质、功能、生物学意义等知识的基础上,首先构建了一个分子标签数据库,数据库中包含了多个功能基因集。通过分析一组处于两个生物学状态的基因表达谱杂交数据,它们在特定的功能基因集中的表达状况,以及这种表达状况是否存在某种统计学显著性。GSEA是从另一个角度来诠释生物信息,可进一步完善我们对相关生物学事件的认识。

【Abstract】 GSEA is one of free tools for analyzing the genome microarray data.It created a molecular signatures database based on the known knowledge of the positions,characteristics,functions,biological meanings of genes,the databse contained many different functional gene sets.Two groups of microarray data,such as experimental and control groups,were analyzed by GSEA,so the enrichment situations of the genes in some chosen gene sets could be learned,even the enrichment had statistic significant or not.GSEA explained the biology information in a different way,and could improve the understanding of related biology processes and drive further research in some areas.

【关键词】 GSEA基因表达谱数据分析
【Key words】 GSEAgene profilesdata analysis
【基金】 国家自然基金资助项目[No:30772167];广州市科技计划项目[No:2008J1-C131]
  • 【文献出处】 现代生物医学进展 ,Progress in Modern Biomedicine , 编辑部邮箱 ,2009年13期
  • 【分类号】Q78
  • 【被引频次】22
  • 【下载频次】3377
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络