濒危鱼类稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列多态性-中国学术期刊网络出版总库

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濒危鱼类稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列多态性

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【英文篇名】	Sequence polymorphism of mtDNA D-loop in the population of the endangered species Onychostoma rara from the Qingshui River
【下载频次】	★★★★★
【作者】	彭珊; 代应贵;
【英文作者】	PENG Shan; DAI Ying-gui(College of Animal Sciences; Institute of Special Aquaculture; Guizhou University; Guiyang 550025; China);
【作者单位】	贵州大学动物科学学院贵州大学特种水产研究所;
【文献出处】	水产学报 , Journal of Fisheries of China, 编辑部邮箱 2009年 02期期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	稀有白甲鱼; mtDNA; D-loop; 多态性; 遗传多样性;
【英文关键词】	Onychostoma rara; mtDNA; D-loop; polymorphism; genetic diversity;
【摘要】	采用PCR、克隆结合DNA测序技术对分布于贵州清水江的30尾稀有白甲鱼个体mtDNA D-loop 3′端共计478 bp的碱基序列进行了测定分析。该序列共发现了25个多态位点,约占其核苷酸总数的5.23%。其中23个为转换位点(A-G,C-T),2个为转换与颠换同时存在的位点。30尾个体分属18种单倍型。稀有白甲鱼mtDNA核苷酸多样性(π)为0.010 7,平均核苷酸差异数(K)为5.092。单倍型多样度(H)为0.940,单倍型间平均遗传距离(P)为0.014。用单倍型间遗传距离构建的NJ系统树由2个支系组成。稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列存在着丰富的多态性,表明该种群具有丰富的遗传多样性。
【英文摘要】	The species Onychostoma rara,belonging to Cyprinidae,Cypriniformes,is endemic to China and distributed only in the Yuanjiang River and the Xijiang River systems.The species has been listed as the endangered one now.To evaluate the present state of genetic diversity of Onychostoma rara,the sequence polymorphism of mtDNA D-loop of the species is studied for the first time on the basis of determination of the 478 bp sequences from 3′ end of mtDNA D-loop in the 30 individuals of the species collected from the Q...
【基金】	国家自然科学基金项目(30760189); 贵州省科学技术基金项目[黔科合J字(2007)2062]; 贵州省省长基金项目[黔省专合字(2005)347]
【更新日期】	2009-03-26
【分类号】	S917.4
【正文快照】	稀有白甲鱼(Onychostoma rara)属鲤形目(Cypriniformes)鲤科(Cyprinidae)鲃亚科(Barbinae)白甲鱼属(Onychostoma),分布于我国长江中游沅江水系和西江水系[1],为当地的重要野生经济鱼类。近年来,稀有白甲鱼资源日趋枯竭,现已被列为濒危鱼类[2]。m tDNA D-loop又称控制区,位于tRN

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