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基于药效团模型从中草药数据库中搜索gpIIb/IIIa受体抑制剂

Discovery of Inhibitors for gpIIb/Ⅲa Receptor from Chinese Herbal Drugs Database by Pharmacophore-Based Virtual Searching

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【作者】 李旭东徐筱杰胡娟

【Author】 LI Xu-Dong1 XU Xiao-Jie1, HU Juan2, (1College of Chemistry and Molecular Engineering, Peking University, Beijing 100871, P. R. China;2Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350108, P. R. China)

【机构】 北京大学化学与分子工程学院福建中医学院 北京100871北京100871福州350108

【摘要】 选择20个3,4-二氢-1(1H)-异喹啉酮类gpIIb/IIIa受体抑制剂作为训练集,利用Catalyst软件包建立了gpIIb/IIIa受体抑制剂三维药效团模型.探讨了药效团作用模式.并通过建立的可靠性最佳的药效团模型(线性回归系数r=0.7715),从中草药数据库中虚拟筛选了gpIIb/IIIa受体抑制剂,通过实验活性测定得到了8个抑制ADP活化全血血小板聚集的IC50从40到100μmol·L-1的化合物,进一步证明了所建药效团模型的有效性.

【Abstract】 3D pharmacophore model was characterized using a training set of gpIIb/Ⅲa inhibitors which consisted of 20 3,4-dihydro-1(1H)-isoquinolinone-based antagonists by the Catalyst program. The best models (linear r=0.7715) were used as database search queries to identify active compounds for glycoprotein IIb/Ⅲa receptor from the Chinese herbal drugs database (CHDD) and eight active compounds were found by further activity-determined experiment. The validity of the pharmocophore model was proved further by the experimental results.

【基金】 国家自然科学基金(20375002,90612015);陈可冀中西医结合发展基金(CKJ20060004);福建省卫生厅中医药研究项目(wzy0607)资助
  • 【文献出处】 物理化学学报 ,Acta Physico-Chimica Sinica , 编辑部邮箱 ,2008年02期
  • 【分类号】R285
  • 【被引频次】11
  • 【下载频次】431
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