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猪肌生成抑制素基因去信号肽蛋白二级构预测和B细胞表位分析

Prediction of the Secondary Structure and Analysis of B-cell Epitopes for Eliminated-signal Protein of MSTN in Swine

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【作者】 金定恩张力青姚艳丰韩丽梁爱心滑国华杨利国

【Author】 Jin Dingen Zhang Liqing Yao Yanfeng Han Li Liang Aixin Hua Guohua Yang Liguo (Key Laboratory of Animal Breeding and Reproduction,Ministry of Education, College of Animal Science and Technology,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070)

【机构】 华中农业大学动物科技学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

【摘要】 目的预测猪肌生成抑制素去信号肽蛋白的二级结构和B细胞优势抗原表位,为生产该蛋白的单克隆抗体、建立噬菌体抗体库、研制针对该基因的表位多肽疫苗、表位核酸疫苗等奠定基础。方法根据猪肌生成抑制素去信号肽蛋白氨基酸序列,应用7种参数和方法分析预测二级结构和抗原表位,包括Garnier-Robson、Chou-Fasman、Karplus-Schulz、Kyte-Doolittle、Emini、Jameson-Wolf及吴氏综合预测方法。结果MSTN去信号肽蛋白存在多个潜在的抗原表位位点,其中B细胞抗原优势表位可能在1-11、41-55、57-64、62-90、99-104、138-144、193-200、202-212、235-243区段或其附近,此结果将为进一步鉴定和合成多肽疫苗和表位核酸疫苗制备抗猪MSTN蛋白抗体提供依据,并为研究MSTN结构和功能奠定基础。

【Abstract】 Objective:To predict the secondary structure and the B-cell epitopes of swine’s MSTN in which the signal peptide has been eliminated,to prepare for producing the Monoclonal antibody,constructing phage antibody library, studying the multiepitopes-peptide vaccine and multiepitopes-genitic vaccine of the protein.Methods:according to the amino acid sequence of the protein,seven parameters and methods were used to analyze the secondary structure and the B-cell epitopes,including Gamier-Robson、Chou-Fasman、Karplus-Schulz、Kyte-Doolittle、Emini、Jameson-Wolf and Wu’s methods. Result:The results showed that MSTN contains many distinct antigenic epitopes and the appropriate peptide sequence was probably at or adjacent to its fragment No.1-11、41-55、57-64、62-90、99-104、138-144、193-200、202-212 and 235-243.The results of the study is helpful for further epitopes identification and design of multiepitopes-based vaccine of MSTN,it also provides a base for the studies on structure and function of MSTN.

【关键词】 MSTN蛋白二级结构B细胞表位
【Key words】 SwineMSTNSecond structure of proteinsB-cell epitopes
【基金】 国家自然科学基金(30270959)资助。
  • 【文献出处】 生物技术通报 ,Biotechnology Bulletin , 编辑部邮箱 ,2008年S1期
  • 【分类号】S828;Q51
  • 【被引频次】4
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