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利用ITS-5.8S rDNA序列对2株海洋亚历山大藻进行的分子鉴定

The Molecular Identification of Two Strains of Alexandrium sp.Using ITS-5.8S rDNA Sequences

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【作者】 黄健梁姗秦洁

【Author】 HUANG Jian1 LIANG Shan1,2 QIN Jie3(1.College of Marine Life Sciences,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;2.Department of Life Science,Yangtze Normal University,ChongQing 408000,China;3.North China Sea Monitering Center,State Ocean Administration Qingdao 266033,China)

【机构】 中国海洋大学海洋生命学院国家海洋局北海环境监测中心 山东青岛266003山东青岛266003长江师范学院生命科学系重庆408000山东青岛266033

【摘要】 扩增2株分离自青岛胶州湾、从形态上初步确定为亚历山大藻属(Alexandriumsp.qd2,Alexandriumsp.qd3)的5.8S核糖体基因(5.8S rDNA),转录单元内间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)序列、部分18S rDNA和28SrDNA序列。通过blastn比对、系统进化树以及遗传距离分析将A.sp.qd2和A.sp.qd3鉴定为A.catenella,且属于A.catenella的不同株型。

【Abstract】 The 5.8S rDNA,ITS,partial 18S rDNA and 28S rDNA sequences were amplified from two Alexandrium sp.strains(Alexandrium sp.qd2.Alexandrium sp.qd3),which were isolated from Jiaozhou bay of Qingdao,and preliminarily identified as Alexandrium sp.based on morphological features.By blastn analysis,phylogenetic tree construction and genetic distance calculation,Alexandrium.sp.qd2 and Alexandrium.sp.qd3 were identified as A.catenella,and belong to different strains of A.catenella.

【关键词】 rDNAITS亚历山大藻分子鉴定
【Key words】 rDNAITSAlexandrium sp.molecular Identification
【基金】 中国海洋大学理科基金项目(2005年)资助
  • 【文献出处】 中国海洋大学学报(自然科学版) ,Periodical of Ocean University of China , 编辑部邮箱 ,2008年02期
  • 【分类号】X173
  • 【被引频次】16
  • 【下载频次】255
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