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牦牛乳酸脱氢酶B基因突变体的克隆鉴定研究
【摘要】 通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分析证实牦牛(Bos grunniens)乳酸脱氢酶存在两种类型,根据LDH同工酶谱的特点推测牦牛LDH多态是由B基因变异所致,并由此将凝胶电泳中迁移率快的LDH同工酶谱带称为LDH-Bf类型,迁移率慢的称为LDH-Bs类型.为阐明牦牛LDH变异体的分子机制,实验从牦牛心脏组织中提取总RNA,采用RT-PCR方法分别克隆了LDH-Bf和LDH-Bs两种类型的B基因cDNA全长序列;序列比对分析发现LDH-Bf和LDH-Bs基因存在4个碱基差异;依据cDNA序列推导的氨基酸序列的比对分析,发现两者之间存在两个氨基酸差异;利用Deepview分子建模软件进行的牦牛H亚基及LDH1突变体的高级结构预测,发现突变的两个氨基酸都能产生新的H键,影响整个蛋白分子的H键网络,并进一步导致蛋白分子空间结构的变化.
【关键词】 牦牛(Bos grunniens)；
乳酸脱氢酶；
遗传变异体；
基因克隆；
分子建模；
【基金】 四川省青年科技基金(批准号:05ZQ026-024);国家民委课题;国家重点基础研究发展计划(批准号:2006CB102100);教育部“新世纪优秀人才支持计划”(批准号:NCET-04-0135)资助项目
- 【文献出处】 中国科学(C辑:生命科学) ,Science in China(Series C:Life Sciences) , 编辑部邮箱 ,2008年02期
- 【分类号】Q78;S823
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