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WSSV-VP39基因克隆与结构分析

Clone and sequence analysis of white spot syndrome virus (WSSV)-VP39 gene

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【作者】 刘庆慧韩文君杨冰黄倢

【Author】 LIU Qing-hui HAN Wen-jun YANG Bing HUANG Jie(Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071)

【机构】 中国水产科学研究院黄海水产研究所中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛266071青岛266071

【摘要】 根据已公布的WSSV-VP39全基因序列(GenBank No.AAL89161)设计1对引物,经PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳分析,扩增出约898bp的特异条带,将其回收后克隆入pGAPZα-A载体中,并进行序列测定与分析。结果表明,扩增序列与Gene Bank登录序列(GenBank No.AAl89161)核苷酸同源性100%。序列分析表明,WSSV-VP39基因编码蛋白无跨膜区域,有多个蛋白激酶C、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和酪氨酸硫酸化位点,1个糖基化位点。蛋白序列比对结果表明,WSSV-VP39与WSSV-VP37具有较高的同源性,其在WSSV侵染中的作用值得关注。

【Abstract】 PCR primer was designed according to WSSV-VP39 nucleotide sequence from GenBank. After PCR reaction and electrophoresis analysis, a specific 898bp DNA band was amplified and cloned into vector of pGAPZα-A. Nucleotide sequence analysis showed that the sequence amplified was 100 % identity with the sequence of GeneBank(GenBank No.AA l89161)of WSSV-VP39. Predicted protein from nucleotide sequence of WSSV-VP39 had no notable transmembrane region, but contained much PKC-PHOSPHO-SITE, CK2-PHOSPHO-SITE, SULFATION -SITE. BLAST protein results showed that WSSV-VP39 had high homology with WSSV-VP37. The function of WSSV-VP39 in the course of WSSV infection claims attention.

【关键词】 WSSV-VP39基因克隆序列分析
【Key words】 WSSV-VP39 Gene Clone Sequence analysis
【基金】 国家高技术发展计划项目(2006AA100312);国家重点基础研究项目(2006CB101801)资助
  • 【文献出处】 海洋水产研究 ,Marine Fisheries Research , 编辑部邮箱 ,2007年05期
  • 【分类号】S945
  • 【被引频次】4
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