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基于有效性测度的基因表达数据的模糊聚类分析

On the Fuzzy Clustering of the Gene Expression Data Based on Validity Measurement

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【作者】 刘青邓庆山

【Author】 LIU Qing1,DENG Qing-shan2 (1School of Information,Renmin University of China,Beijing 100872;2School of Computer Science and Technology,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430074,China)

【机构】 中国人民大学信息学院华中科技大学计算机科学与技术学院 北京100872湖北武汉430074

【摘要】 本文讨论了模糊聚类中的模糊C均值算法和聚类有效性测度。结合基因微阵列的特点,设计并实现了一种基于聚类有效性函数的模糊C均值模型。将该种模型运用于公开的白血病基因表达数据,取得了与实际情况相吻合的实验结果。

【Abstract】 This paper discusses the fuzzy C-means algorithm(FCM) , one of the fuzzy clustering methods and clustering validity measurements. Considering the characteristics of microarray, we design and realize a FCM model based on clustering validity functions. We apply the model to the gene expression data of leukaemia and gain a good result which is close to the fact.

【基金】 国家自然科学基金资助项目(90203011)
  • 【文献出处】 计算机工程与科学 ,Computer Engineering & Science , 编辑部邮箱 ,2005年09期
  • 【分类号】TP301
  • 【被引频次】8
  • 【下载频次】128
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