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微阵列数据中一种改进Bagging决策树算法的研究

On an Improved Bagging Decision Tree Algorithm in Microarray Data

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【作者】 刘青李海峰袁科

【Author】 LIU Qing 1,2 , LI Hai feng 1,YUAN Ke 3 (1. School of Computer Science and Tehnology, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074; 2. Information School, Renmin University of China ,Beijing 100872; 3. Department of Electrical Engineering,Hubei Automotive Industries Institute,Shiyan 442002,China)

【机构】 华中科技大学计算机科学与技术学院湖北汽车工业学院电气工程系 湖北武汉430074中国人民大学信息学院北京100872湖北武汉430074湖北十堰442002

【摘要】 针对基因微阵列数据具有高维度、小样本等独特的特点,本文研究并实现了旨在降低计算时间和提高精确度的Bagging决策树。本文提出了一个能极大地降低计算时间、同时对精确度影响不大的属性离散化过程,接着以一种新的类分布置信度的方式构造决策树,该方法在最终的Bagging组合方面有一定的优势。结合上述方法的Bagging决策树算法在基因微阵列数据集分类上取得了良好的效果。

【Abstract】 Based on the characteristics of high dimension and small sample, this paper investigates the improvements of bagging decision trees which aim mainly at improving computation time and accuracy. A discretization procedure is proposed, resulting in a dramatic speedup without significant decrease in accuracy. Then a new class distribution confidence is suggested improving the accuracy of the final bagging decision tree. Combining these improvements makes it get excellent performance on gene microarray data.

【基金】 国家“十五”重大科技专项课题(2001BA102A06 11)
  • 【文献出处】 计算机工程与科学 ,Computer Engineering & Science , 编辑部邮箱 ,2005年06期
  • 【分类号】TP18
  • 【被引频次】2
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