节点文献

常规PCR与RACE结合法快速从cDNA文库中克隆基因

Rapidly Cloning Gene from cDNA Liprary Using Common PCR and RACE Combined Method

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 戚金亮马小娟王丽印莉萍韩振海

【Author】 Qi Jinliang 1,2 Ma Xiaojuan+2 Wang Li+2 Yin Liping+2 Han Zhenhai+1(1 Molecular Biology Laboratory of Fruit Tree,Agriculture and Biotechnology college of China Agricultural University,Beijing 100094;2^The Key Laboratory of Genetics and Biotechnology,Biology Department of Capital Normal University,Beijing 100037)

【机构】 中国农业大学农学与生物技术学院果树分子生物学实验室首都师范大学生物系遗传与生物工程重点实验室中国农业大学农学与生物技术学院果树分子生物学实验室 北京100094北京100037北京100094

【摘要】 首先根据Fe(Ⅱ ) 转运蛋白基因家族的保守区设计同源的常规PCR引物 (F1,R1) ,扩增出 4 90bp的特异片段 .然后根据RACE法原理 ,巧妙地设计 3′RACE(F2 )和 5′RACE(R3)特异性引物 ,使两者既能分别与文库载体上的筛选扩增引物配对扩增cDNA 3′和 5′末端序列 ,又能使扩增出的 3′RACE和 5′RACE产物序列有重叠部分 ;另外设计引物时还兼顾到使F2和R3也能配对 ,从而能对 3′RACE和 5′RACE扩增产物进行双特异性引物常规PCR鉴定 .该方案不但能够直接根据序列鉴定 3′RACE和 5′RACE产物是否为同一基因序列 ,还能快捷地用常规PCR鉴定 3′RACE和5′RACE扩增产物是否为特异性扩增 ,避免了对非特异性扩增产物的克隆测序等繁琐的鉴定过程 ,优化了基因克隆策略 .最后根据拼读出的全长序列设计引物 (F4 ,R4 )扩增出完整编码区 .应用该方法成功地从小金海棠缺铁处理的根系cDNA文库中克隆了Fe(Ⅱ ) 转运蛋白基因的cDNA .说明该方案是一种从cDNA文库中克隆目的基因的快捷优化方法

【Abstract】 We have got 490 bp of Fe(Ⅱ)-transporter gene first by planning primers for common PCR according to the conserved domains of Fe(Ⅱ)-transporter gene family.Then,we plan 3′RACE (F2) and 5′RACE(R3) primers which not only can anneal with screening amplimer of cDNA library vector respectively,but also can make the sequence of 3′RACE and 5′RACE have overlapped part.On the other hand,these two primers can anneal with each other which can rapidly identify the products of 3′RACE and 5′RACE according to their sequences.This plan not only ensures that the products of 3′RACE and 5′RACE are the parts of one same gene,but also can identify if the products are special product rapidly,which avoids cloning and sequencing each product for identifying and makes the clone process easily.At last,we amplified the full ORF by planning primers(F4,R4) according to the full cDNA sequence.We have cloned the cDNA of Fe(Ⅱ)-transporter gene successfully from the cDNA library of Malus xiaojinensis Cheng et Jiang,which proves that this plan is a rapid method to clone gene from cDNA library.

【关键词】 PCRRACEcDNA克隆cDNA文库Fe(Ⅱ)-转运蛋白基因
【Key words】 PCRRACEcDNA cloningcDNA libraryFe(Ⅱ)-transporter gene.
【基金】 国家自然科学基金项目 ( 3 0 170 5 5 2 );教育部“高等院校青年教师科教奖励”基金;北京市自然科学基金委重点实验室“果树逆境生理研究室”资助项目
  • 【文献出处】 首都师范大学学报(自然科学版) ,Journal of Capital Normal University , 编辑部邮箱 ,2004年01期
  • 【分类号】Q78
  • 【被引频次】12
  • 【下载频次】1301
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络