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DNA芯片快速检测耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因突变

Rapid detection of mutation in the rpoB gene of rifampin-resistant mycobacterium tuberculosis by DNA chip

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【作者】 单万水单金岚詹能勇黄慧平余卫业叶淦湖蔡佩欣杨梦甦向筑廖生赟张旭

【Author】 SHAN Wan-shui , SHAN Jin-lan,ZHAN Neng-yong,HUANG Hui-ping,YU Wei-ye,YE Gan-hu,CAI Pei-xin,YANG Meng-su,XANG Zhu,LIAO Seng-yun,ZHANG Xu. Depaetment of Laboratory Medicine, Shenzhen Eastlake Hospital, Shenzhen 518020, China

【机构】 深圳市东湖医院检验科东莞市石碣人民医院香港城市大学基因组开发应用中心亚能生物技术深圳有限公司亚能生物技术深圳有限公司 518020518020

【摘要】 目的 开发快速检测耐利福平结核分枝杆菌 (结核菌 )rpoB基因突变的DNA芯片。方法 根据结核菌rpoB基因序列设计探针并制作基因芯片 ,从临床样品中分离出结核菌的基因组DNA ,PCR扩增含有rpoB基因突变位点的特异DNA片段 ,荧光标记后与芯片上含有的检测特异突变位点的寡核苷酸探针进行杂交 ,同时与DNA直接测序法测定序列比较。结果  35株耐利福平结核菌中有 91 4 % (32 / 35 )用直接测序法检测出存在rpoB基因突变 ,DNA芯片的检测效率为 71 4 % (2 5 / 35 )。结论 用DNA芯片检测结核菌对利福平的耐药性具有较高的特异性和敏感性 ,可用于临床结核菌耐药性检测。

【Abstract】 Objective To develop a new DNA chip for rapid detection of rpoB gene mutation in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis isolated from clinical laboratorial specimen. Methods 9 oligonucleotide probes specific for detection of the mutant sequences in rpoB gene were designed. Results Mutations were found in 32 strains (91.4%) of 35 randomly selected rifampin-resistant M. tuberculosis by PCR-direct sequencing technique. 25 mutations (71.4%) were found by DNA chip. Conclusion DNA chip technology has high sensitivity and specificity in detection of rifampin-resistant M. tuberculosis and may be applied in clinical diagnosis.

【关键词】 DNA利福平结核基因
【Key words】 DNARifampinTuberculosisGene
【基金】 香港特区政府创新科技基金 (SERAP :S/P5 99/0 3A)
  • 【文献出处】 中华检验医学杂志 ,Chinese Journal of Laboratory Medicine , 编辑部邮箱 ,2003年11期
  • 【分类号】R446.5
  • 【被引频次】20
  • 【下载频次】113
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