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重复序列查找软件Repfind的原理与结构简介

Principle, Structure and Application of Repfind Software

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【Author】 LIU Zhixue,TANG Yuanping,ZHAO Jing,GUO Jingkang(1.School of Life Sciences, Shanghai University, Shanghai 200436, China;2. School of Sciences, Shanghai University, Shanghai 200436, China)

【机构】上海大学生命科学学院；上海大学理学院上海200436；上海200436；上海200436；

【摘要】重复序列查找是基因组学的重要内容之一.该文结合我们自己的回顾性分析结果,对重复序列查找程序Repfind的原理、结构和使用方法进行了简单的介绍.更多还原

【Abstract】 The finding of repetitive elements is an important task in genomics research. We give a brief introduction for the principle, structure and application of the software Repfind used in repetitive elements.更多还原

【关键词】重复序列； Repfind；局部联配；动态规划；启发式联配算法；
【Key words】 repetitive sequence； Repfind software； local alignment； dynamic programming； heuristic alignment algorithm.；

【文献出处】上海大学学报(自然科学版) ,Journal of Shanghai University(Natural Science Edition) , 编辑部邮箱 ,2003年02期

【分类号】Q343.1
【下载频次】268

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