水稻含隐性抗白叶枯病基因xa5的24kb片段的鉴定与基因预测

【摘要】 水稻xa5基因是具有重要研究和育种价值的隐性广谱抗白叶枯病基因。利用水稻品系IR24及其近等基因系IRBB5（含xa5基因）杂交组合,构建了含4892个单株的F₂定位群体。同时,利用与xa5连锁的RFLP标记筛查含xa5基因的水稻抗性品系IRBB56的BAC文库,构建了一个覆盖目标基因位点的长约213 kb的跨叠克隆群。根据国际水稻基因组和中国超级杂交稻基因组序列,以及跨叠克隆群的部分亚克隆测序,设计了一系列SSLP和CAPS标记对目标基因进行精细遗传定位。xa5基因定位在2个CAPS标记K5和T4之间且与T2共分离,标记K5和T4之间的遗传距离为0.3 cM,物理距离约为24 kb。对xa5基因所在的24 kb片段DNA序列进行基因预测,揭示出可能编码ABC转运蛋白和转录因子TFIIA小亚基的2个基因。对这一区段及其编码基因的功能研究将阐明xa5抗白叶枯病的分子机制。更多还原