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DNA结合蛋白质的AFM图像分析
The analysis of DNA-binding protein’ s AFM image
【摘要】 原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)在研究DNA与蛋白质的相互作用方面具有重要的应用。本文对DNA结合蛋白的AFM像的分析方法进行了研究,通过分析DNA及其与蛋白质结合的AFM图像,我们可以计算出已知序列DNA的长度及其未知DNA结合蛋白质在DNA链上的位置信息,从而可以估计该蛋白质的DNA结合位点序列。结果证明对AFM图像的分析可以得到DNA结合蛋白的位置信息。该研究对于寻找新的DNA结合蛋白,研究生物体中遗传信息的复制、转录、修复和重组的分子生物学机制具有重要意义。
【Abstract】 Atomic force microscope(AFM) has been applied to study DNA-protein interaction. It analyzed the processing methods of the AFM image of DNA-binding protein. By analyzing the AFM image, it can calculate the DNA length and the binding sites of DNA-binding proteins, then the binding motif of a protein can be predicted. It proves that it can provide more information about DNA-binding protein using AFM image analysis than raw AFM image. This research will facilitate to find new DNA-binding protein, and it is important to reveal the molecular mechanisms of DNA replication and transcription and DNA repair and recombination.
【Key words】 DNA-binding protein; AFM image; DNA length calculating; protein binding site; image processing;
- 【文献出处】 计算机与应用化学 ,Computers and Applied Chemistry , 编辑部邮箱 ,2003年Z1期
- 【分类号】Q75
- 【被引频次】9
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