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扬子鳄4个Sox基因保守区的克隆及序列分析

Amplification and Sequencing of Sox Gene HMG-box in Alligator sinensis

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【作者】 陈冬生聂刘旺程双怀阚显照王朝林谢万树

【Author】 CHEN Dong sheng 1,NIE Liu wang 1,CHENG Shuang huai 1,KAN Xian zhao 1, WANG Chao lin 2,XIE Wan shu 2 (1.College of Biological Science,Anhui Normal University,Wuhu 241000,China; 2.The Breeding Centre of Alligator sinensis,Xuancheng 242000,China)

【机构】 安徽师范大学生命科学学院宣城扬子鳄养殖中心宣城扬子鳄养殖中心 安徽芜湖241000安徽芜湖241000安徽宣城242000安徽宣城242000

【摘要】 参考人SRY基因HMG box的保守区序列 ,设计一对简并引物 ,用PCR扩增了扬子鳄Sox基因的HMG box ,并对PCR产物进行了亚克隆和测序。结果在雌雄个体中均筛选到 4个不同的Sox基因 ,无性别差异。其序列与人相应的SOX基因保守区编码序列的相似性分别为 91%、 96 %、 10 0 %、 96 % ,分别命名为AS Sox1,ASSox2 ,ASSox11,ASSox2 2。与其他动物相关的Sox/SOX基因的聚类分析结果表明 ,扬子鳄Sox基因编码的氨基酸序列与进化位置各异的其他动物的Sox/SOX基因编码的氨基酸序列存在高度的同源性 ,显示出Sox基因在系统进化上的高度保守性

【Abstract】 bp fragments of Sox gene HMG box in Alligator sinensis were amplified by PCR,and then sub cloned and sequenced.Four different Sox genes were thus identified in both male and female.The encoded amino acid sequences exhibited 91%,96%,100%,and 96% of sequence homology with those reported for human SOX gene HMG boxes,respectively.According to nomination system of human SOX genes,the newly identified Alligator sinensis Sox genes were named as ASSox 1, ASSox 2, ASSox 11, ASSox 22,respectively.There was no sexual difference in the four fragments.The amino acid sequences coded by Sox genes from amphibian,reptile,bird,and human showed a high degree of sequence homology within the respective four clusters,as revealed in phylogenetic tree constructed.The results indicated that Sox genes were highly conservative in phylogeney.

【关键词】 扬子鳄Sox基因序列分析
【Key words】 Alligator sinensisSox geneSequence analysis
【基金】 安徽省自然科学基金资助项目 ( 0 10 43 2 0 2 ) ;安徽省教育厅自然科学基金重点项目 ( 2 0 0 1kj113 ) ;安徽省优秀青年基金资助项目 ;安徽省教育厅自然科学基金资助项目 ( 2 0 0 2kj12 8) ;安徽师范大学青年基金资助项目 ( 12 5 0 3 0 )
  • 【文献出处】 动物学研究 ,Zoological Research , 编辑部邮箱 ,2003年02期
  • 【分类号】Q785
  • 【被引频次】15
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