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天山根瘤菌(R.tianshanense)模式菌株16SrDNA全序列测定及其系统发育

Phylogeny of R. tianshanense Based on 16SrDNA Sequences

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【作者】 谭志远牛天贵陈文新

【Author】 Tan Zhiyuan; Niu Tiangui; Chen Wenxin(Department of Microbiology, College of Biological Sciences, China Agricultural University,Beijing 100094 )

【机构】 中国农业大学生物学院!北京100094

【摘要】 对天山根瘤菌群的模式株A-IBS(=CCBAU3306)16SrDNA的全序列进行了测定,以确定它在系统发育中的地位。实验中设计了6个引物,通过聚合酶链反应扩增天山根瘤菌模式菌株A-IBS的16SrDNA。应用DNA定向测序技术,获得了菌株A-IBS的16SrDNA全序列,将所得序列与根瘤菌已知种的模式菌株16SrDNA全序列一起进行聚类分析,得到了系统发育树状图。在树状图中,菌株A-IBS所代表的根瘤菌群与华癸根瘤菌(R.huakuu)群、鹰嘴豆根瘤菌(R.ciceri)群、地中海根瘤菌(R.mediterrranean)群及百脉根根瘤菌(R.loti)群的亲缘关系较近,与其它根瘤菌群的亲缘关系较远,存在着属水平的差异,表明了这些相近根瘤菌群构成了根瘤菌的一个独立的发育系。

【Abstract】 Six primers are designed. 16SrDNA of type strain A-IBS (= CCBAU 3306 ) of R. tianshanense is amplified by polymerase chain reaction (PCR) and its sequence from direct DNA sequencing is obtained.Based on the anlalysis of 16SrRNA gene sequence of related sabins, a phylogenetic tree has been produced,which shows that the phylogenetic position of strain A-IBS is closely related to R. huakuii, R. ciceri, R.mediterranean, R. loti and distinct from other species of Rhizobium.

【关键词】 天山根瘤菌16SrDNA全序列系统发育
【Key words】 R. tianshenenre16SrDNA sequencePhylogeny
【基金】 国家自然科学基金
  • 【文献出处】 高技术通讯 ,HIGH TECHNOLOGY LETTERS , 编辑部邮箱 ,1997年01期
  • 【分类号】Q933
  • 【被引频次】9
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