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水稻矮缩病毒第十二号基因组份的cDNA合成与分子克隆及全序列分析

cDNA SYNTHESIS,MOLECULAR CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF RICE DWARF VIRUS SEGMENT S12*

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【作者】 李毅薛志宏刘一飞全胜潘乃陈章良

【Author】 Li Yi Xue Zhihong Liu Yifei Quan Sheng Pan Naisui Chen Zhangliang(National Laboratory for Protein Engineering and Plant Genetic Engineering,College of Life Science,Peking University,Beijing,100871)

【机构】 北京大学生命科学学院

【摘要】 应用聚合酶链式反应技术(PCR)扩增了水稻矮缩病毒(RDV)中国福建分离物基因组第12号片段(S12)的全基因序列,并对该基因进行了亚克隆和序列分析。结果表明克隆片段全长为1066bp,含有4个开放阅读框架(ORF),分别编码34kD、8kD、7kD和4kD的多肽。与日本RDVS12在核苷酸水平上的同源率为94.5%,与相应ORF(ORF1-4)编码多肽的同源率分别为91.3%、97.8%、97.6%和84.4%。此外,将这几个ORF编码的多肽与同组伤瘤病毒(WTV)、水稻瘿矮病毒(RGDV)相应ORF编码的多肽进行同源性比较发现,34kD多肽与WTV和RGDV相应多肽无显著的序列同源性,但ORF2和ORF3编码的多肽在同组中却有明显的保守性。由此说明这几种小的多肽在病毒侵染和复制中有着十分重要的作用。

【Abstract】 ice Dwarf Virus(RDV)segment S12 full length cDNA was synthesized and amplified by polymerase chain reaction(PCR).The PCR product was cloned and sequenced.The results have shown that the cloned fragment is 1,066bp in length and contains four open readingframes(ORF).The four ORFs encode four polypepetides with molecular weight of 34kD(ORF1),8kD (ORF2),7kD (ORF3)and 4kD (ORF4),respectively.Amino acid sequence comparison of polypepetides encoded by RDV S12 ORF1,ORF2,ORF3 and ORF4 of Chinese Fujian and Japanese isolated showed significant homology (91.3%,97.8%,97.0%and 84.4%,for ORF1,2,3 and 4,respectively).In addition,amino acid sequence comparison of small polypepetides encoded by RDV S12 ORF2-3 with WTV and RGDV S9 small ORFhave shown that the small ORFs are conservative in the phytoreovirus genus.These resultssuggest that the small ORF may play a very important functions in vivo.

【基金】 国家科委863水稻抗病毒基因工程资助课题
  • 【文献出处】 病毒学报 ,CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY , 编辑部邮箱 ,1994年04期
  • 【分类号】S432.41
  • 【被引频次】15
  • 【下载频次】144
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