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用特异性探针进行YAC重叠群的构建

Identification of YAC Contig by Specific Probes

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【作者】 顾杨洪柴建华

【Author】 Gu Yanghong;Chai Jianhua;Institute of Genetics,Fudan University;

【机构】 复旦大学遗传学研究所

【摘要】 将全长为14kb DMD cDNA特异性探针划分为9个亚探针,作为染色体界标,用每个特异性的亚探针与已筛选出的DMD YAC克隆杂交,根据杂交所得到的结果分析,可以将有关的YAC克隆依次排列,形成一个大约3000kb的YAC克隆重叠群。这种方法快而准确,是目前人类基因组分析中进行克隆排序的有效方法之一。

【Abstract】 The 14 kb complete DMD eDNA probe was divided into 9 pieces of quasi-probes: 1—2a (1—1538bp), 2b—3(1455—2600bp), 4—5a(2600—4550bp), 5b—7(4400—6900 bp), 8(6900-7800 bp), 9 (7800—9282 bp), 10(9081—9786), 10—13(9282—12972 bp) and 14(12973—13973 bp). Each quasi—probe was hybridized with DMD YAC clones isolated from human genome YAC library. The results showed that the DMD-YAC contig from 5’—3’was DMD-YAC5—DMD-YAC7—DMD.-YAC11—DMDYAC3—DMD-YAC19. This method was very efficient for complex genome analysis, especially for long---range mapping.

【关键词】 YAC重叠群DMD基因基因组分析
【Key words】 YAC contigsDMD geneGenome analysis
【基金】 863计划资助项目
  • 【文献出处】 高技术通讯 ,High Technology Letters , 编辑部邮箱 ,1992年10期
  • 【分类号】Q78
  • 【下载频次】7
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